R语言 qpgraph包 qpPlotNetwork()函数中文帮助文档(中英文对照)

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qpPlotNetwork(qpgraph)
qpPlotNetwork()所属R语言包：qpgraph

                                         Plots a graph
                                         绘制图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a graph using the Rgraphviz library
使用Rgraphviz库绘制图


用法----------Usage----------


qpPlotNetwork(g, vertexSubset=graph::nodes(g), boundary=FALSE,
              minimumSizeConnComp=2, pairup.i=NULL, pairup.j=NULL,
              annotation=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：g
graph to plot provided as a graphNEL-class object.
图的绘制提供graphNEL-class对象。


参数：vertexSubset
subset of vertices that define the induced subgraph to be plotted.
子集的定义要绘制的诱导子图的顶点。


参数：boundary
flag set to TRUE when we wish that the subset specified in vertexSubset also includes the vertices connected to them; FALSE otherwise.
标志设置为TRUE当我们希望中指定的子集vertexSubset还包括连接到它们的顶点;FALSE否则。


参数：minimumSizeConnComp
minimum size of the connected components to be plotted.
连接组件的最小尺寸绘制。


参数：pairup.i
subset of vertices to pair up with subset pairup.j.
顶点子集的子集pairup.j配对。


参数：pairup.j
subset of vertices to pair up with subset pairup.i.
顶点子集的子集pairup.i配对。


参数：annotation
name of an annotation package to transform gene identifiers into gene symbols when vertices correspond to genes.
一个注解包名转换成基因符号，基因标识，当顶点对应的基因。


Details

详情----------Details----------

This function acts as a wrapper for the functionality provided by the Rgraphviz package to plot graphs in R. It should be help to plot networks obtained with the qpgraph package methods.
此功能作用作为Rgraphviz包提供的功能，应当帮助与qpgraph包的方法获得的图网络图绘制在R的包装。


值----------Value----------

The plotted graph is invisibly returned as a graphNEL-class object.
无形返回graphNEL-class对象绘制的图形。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Castelo



参见----------See Also----------

qpGraph qpAnyGraph
qpGraphqpAnyGraph


举例----------Examples----------


require(Rgraphviz)

rndassociations <- qpUnifRndAssociation(10)
g <- qpAnyGraph(abs(rndassociations), threshold=0.7, remove="below", return.type="graphNEL")
qpPlotNetwork(g)

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