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R语言 qpcrNorm包 readQpcr()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:38:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
readQpcr(qpcrNorm)
readQpcr()所属R语言包:qpcrNorm

                                         Data Input Function for a Single qPCR Experiment.
                                         单一的qPCR实验数据输入功能。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function reads in data from a single qPCR experiment. The text file must have the following structure: <br> 1st column = names denoting genes or primer pairs <br> 2nd column = plate index of each gene or primer pair <br> remaining columns = (replicate) Ct values. <br>
该函数读取数据从一个单一的qPCR实验。文本文件必须具有以下结构:参考第一列名称表示基因引物对参考第二列=每个基因或引物对其余列参考(复制)Ct值的板块指数。参考


用法----------Usage----------


readQpcr(fileName, header = FALSE, qc = FALSE, quote = "\"", dec = ".", fill = TRUE, comment.char = "", ...)



参数----------Arguments----------

参数:fileName
Character string.  
字符串。


参数:header
Logical value, TRUE if the file contains the names of the variables as its first line.  
逻辑值TRUE,如果该文件包含的变量的名称作为其第一线。


参数:qc
Logical value, TRUE if a QC filter ctQc should be applied to the data. <br> If qc = F, the replicate Ct values will be averaged.  
逻辑值TRUE,如果一个QC过滤器ctQc应适用于数据。 <br>如果QC =楼将复制的Ct值的平均值。


参数:quote
Set of quoting characters. To disable quoting, set quote = "". See scan for behaviour on quotes embedded in quotes.  
设置援引字符。要禁用报价,设置了“。看到scan引号中嵌入引号的行为。


参数:dec
Character used for decimal points.  
字符使用小数点。


参数:fill
Logical value, TRUE if in case rows have unequal length, blank fields are implicitly added. See read.table.  
逻辑值TRUE,如果万一行,有长度不等的隐式添加,空白领域。看到read.table。


参数:comment.char
Character vector of length one containing a single character or an empty string. Use "" to turn off the interpretation of comments altogether.   
特征向量的长度包含单个字符或一个空字符串之一。使用“完全关闭评论的解释。


参数:...
further arguments to be passed to read.table.  
进一步的参数被传递到read.table。


Details

详情----------Details----------

Note: the majority of arguments to readQpcr are identical to those supplied to read.table. These have been included to  give the user greater control over data input, should the data deviate from a standard tab-delimited file structure.  For a standard tab-delimited text file (without column headings), specifying the fileName should be sufficient.   
注:大多数的参数readQpcr的是提供给read.table相同。这些已列入给用户更好地控制数据输入,数据偏离标准的制表符分隔的文件结构。对于一个标准的制表符分隔的文本文件(不列标题),指定fileName的应该是足够的。


值----------Value----------

A qpcrBatch object.
一个qpcrBatch对象。


作者(S)----------Author(s)----------


Jess Mar <a href="mailto:jess@jimmy.harvard.edu">jess@jimmy.harvard.edu</a>



参见----------See Also----------

readQpcrBatch, ctQc
readQpcrBatch,ctQc


举例----------Examples----------


        ## onerun.data &lt;- readQpcr("singleQpcrRun.txt")[#onerun.data < -  readQpcr(“singleQpcrRun.txt”的)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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