R语言 puma包 plotROC()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotROC(puma)
plotROC()所属R语言包：puma

                                        Receiver Operator Characteristic (ROC) plot
                                         受试者工作特征（ROC）曲线

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a Receiver Operator Characteristic (ROC) curve.
绘制受试者工作特征（ROC）曲线。


用法----------Usage----------


plotROC(
        scoresList
,        truthValues
,        includedProbesets=1:length(truthValues)
,        legendTitles=1:length(scoresList)
,        main = "PUMA ROC plot"
,        lty = 1:length(scoresList)
,        col = rep(1,length(scoresList))
,        lwd = rep(1,length(scoresList))
,        yaxisStat = "tpr"
,        xaxisStat = "fpr"
,        downsampling = 100
,        showLegend = TRUE
,        showAUC = TRUE
,        ...
)



参数----------Arguments----------

参数：scoresList
A list, each element of which is a numeric vector of scores.  
一个列表，其中每个元素是数字向量的分数。


参数：truthValues
A boolean vector indicating which scores are True Positives.  
一个布尔向量表示哪些分数是真阳性。


参数：includedProbesets
A vector of indices indicating which scores (and truthValues) are to be used in the calculation. The default is to use all, but a subset can be used if, for example, you only want a subset of the probesets which are not True Positives to be treated as False Positives.  
表明指数分数（和truthValues）是在计算中使用的矢量。默认是使用的所有问题，但可以使用，例如，如果你只是想这是不是误报处理的真阳性的probesets的一个子集的一个子集。


参数：legendTitles
Vector of names to appear in legend.  
名字出现在传说中的向量。


参数：main
Main plot title  
主要图标题


参数：lty
Line types.  
线路类型。


参数：col
Colours.  
颜色。


参数：lwd
Line widths.  
线宽。


参数：yaxisStat
Character string identifying what is to be plotted on the y-axis. The default is "tpr" for True Positive Rate. See performance function from ROCR package.
确定什么是y轴绘制字符串。默认是“TPR”真阳性率。看到performance从ROCR包的功能。


参数：xaxisStat
Character string identifying what is to be plotted on the x-axis. The default is "fpr" for False Positive Rate. See performance function from ROCR package.
字符串确定什么是x轴绘制。默认是“FPR”假阳性率。看到performance从ROCR包的功能。


参数：downsampling
See details for plot.performance from the ROCR package.   
plot.performanceROCR包看到细节。


参数：showLegend
Boolean. Should legend be displayed?
布尔值。应传说显示吗？


参数：showAUC
Boolean. Should AUC values be included in legend?
布尔值。应包括传说中的AUC值吗？


参数：...
Other parameters to be passed to plot.  
其他参数被传递到plot。


值----------Value----------

This function has no return value. The output is the plot created.
这个函数没有返回值。输出是创建的图。


作者（S）----------Author(s)----------


Richard D. Pearson



参见----------See Also----------

Related method calcAUC
此方法calcAUC


举例----------Examples----------


        class1a <- rnorm(1000,0.2,0.1)
        class2a <- rnorm(1000,0.6,0.2)
        class1b <- rnorm(1000,0.3,0.1)
        class2b <- rnorm(1000,0.5,0.2)
        scores_a <- c(class1a, class2a)
        scores_b <- c(class1b, class2b)
        scores <- list(scores_a, scores_b)
        classElts <- c(rep(FALSE,1000), rep(TRUE,1000))
        plotROC(scores, classElts)

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