R语言 puma包 plot-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plot-methods(puma)
plot-methods()所属R语言包：puma

                                        Plot method for pumaPCARes objects
                                         图pumaPCARes对象方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This is the method to plot objects of class pumaPCARes. It will produce a scatter plot of two of the principal components
这是方法来绘制类pumaPCARes对象。这将产生两个主要组成部分的散点图


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'pumaPCARes,missing'
plot(..., firstComponent = 1, secondComponent = 2, useFilenames = FALSE, phenotype = pData(pumaPCARes@phenoData), legend1pos = "topright", legend2pos = "bottomright")



参数----------Arguments----------

参数：...
Optional graphical parameters to adjust different components of the plot
可选的图形参数来调整不同组成部分的图


参数：firstComponent
Integer identifying which principal component to plot on the x-axis
整数确定主成分上绘制x轴


参数：secondComponent
Integer identifying which principal component to plot on the x-axis
整数确定主成分上绘制x轴


参数：useFilenames
Boolean. If TRUE then use filenames as plot points. Otherwise just use points.
布尔值。如果为TRUE，然后使用文件名作为积点。否则只使用点。


参数：phenotype
Phenotype information
型信息


参数：legend1pos
String indicating where to put legend for first factor
字符串，表示把第一个因素的传说


参数：legend2pos
String indicating where to put legend for second factor
字符串，指示把传说中的第二个因素


举例----------Examples----------


        #        Next 4 lines commented out to save time in package checks, and saved version used[接下来的4行注释掉包检查，以节省时间，并保存版本使用]
    # if (require(affydata)) {[（要求（affydata））{]
        #        data(Dilution)[数据（稀释）]
        #        eset_mmgmos &lt;- mmgmos(Dilution)[< -  mmgmos eset_mmgmos（稀释）]
        # }[}]
        data(eset_mmgmos)
        pumapca_mmgmos <- pumaPCA(eset_mmgmos)
        plot(pumapca_mmgmos)

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