R语言 PROMISE包 spearman.rstat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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spearman.rstat(PROMISE)
spearman.rstat()所属R语言包：PROMISE

                                         Function to Calculate Spearman Correlation Statistics
                                         函数来计算Spearman相关统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to calculate Spearman rank correlation of each gene in an array data with a continuous variable
一个连续变量的一个函数来计算每个基因在阵列数据的斯皮尔曼等级相关


用法----------Usage----------


spearman.rstat(Y, x, strat = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：Y
a numeric data frame. Each row gives values of one genomic variable.  
数字数据框。每一行给出了一个基因组变量的值。


参数：x
a vector of continuous variable.  
连续变量的向量。


参数：strat
a vector of stratum to calculate stratified correlation statistics, default = NULL.  
阶层的向量计算分层的相关统计，默认值= NULL。


值----------Value----------

Return a vector of Spearman rank correlation statistics.
返回向量Spearman秩相关统计。


作者（S）----------Author(s)----------


   
Stan Pounds <a href="mailto:stanley.pounds@stjude.org">stanley.pounds@stjude.org</a>; Xueyuan Cao <a href="mailto:xueyuan.cao@stjude.org">xueyuan.cao@stjude.org</a>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

PROMISE
PROMISE


举例----------Examples----------


## load sampExprSet.[＃加载sampExprSet。]
data(sampExprSet)

## extract expression matrix from sampExprSet[＃提取从sampExprSet表达矩阵]
Y <- exprs(sampExprSet)

## extract end point data from sampExprSet[＃从sampExprSet提取终点数据]
x <- pData(phenoData(sampExprSet))$drugLevel
strat <- pData(phenoData(sampExprSet))$strat

## Calculte Spearman correlation statistics[＃Calculte斯皮尔曼相关统计]
test <- spearman.rstat(Y, x, strat = strat)

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