R语言 procoil包 show-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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show-methods(procoil)
show-methods()所属R语言包：procoil

                                        Functions for CCModel class
                                         CCModel类的功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Display information about CCModel and CCProfile objects
有关CCModel和CCProfile对象显示的信息


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'CCModel'
show(object)
## S4 method for signature 'CCProfile'
show(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of class CCModel or CCProfile
一个对象类CCModel或CCProfile


Details

详情----------Details----------

If called for an object of class CCModel, show displays a summary of data in the CCModel object. Since the number of pattern weights is potentially large, these values are not displayed by show. In order to see the pattern weights (for what reason ever), directly access the weights slot (see example below).
如果一个类的对象调用CCModel，show显示的数据汇总CCModel对象。由于是潜在的大格局重量，这些值不会显示show。以模式的权重（什么原因曾经），直接访问weights槽（见下面的例子）。

If called for an object of class CCProfile, show displays a summary of the prediction result, including the sequence, its heptad register, the discriminant function value, and the final prediction (trimer or dimer). The prediction profile itself is not displayed. To access the profile, directly access the profile slot (see also CCProfile).
如果一个类的对象调用CCProfile，show显示的预测结果的摘要，包括序列，其七肽寄存器，判别函数值，并最终预测（三聚体或二聚体）。预测的文件本身不显示。访问配置文件，直接访问（又见profile）CCProfile插槽。


值----------Value----------

Both variants of show returns an invisible NULL
show两个变种返回一个无形的NULL


作者（S）----------Author(s)----------


Ulrich Bodenhofer <a href="mailto:bodenhofer@bioinf.jku.at">bodenhofer@bioinf.jku.at</a>



参考文献----------References----------


Hochreiter, S. (2011) Complex networks govern coiled coil oligomerization - predicting and profiling by means of a machine learning approach. Mol. Cell. Proteomics.

参见----------See Also----------

procoil, CCModel,
procoil，CCModel


举例----------Examples----------


## display summary of default model[＃显示默认模式的总结。]
show(PrOCoilModel)

## show all pattern weights[＃显示所有模式重]
PrOCoilModel@weights

## predict oligomerization of GCN4 wildtype[＃预测因子GCN4野生齐聚]
GCN4wt<-predict(PrOCoilModel,
                "MKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLV",
                "abcdefgabcdefgabcdefgabcdefga")

## show result[＃显示结果]
show(GCN4wt)

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