rma.background.correct(preprocessCore)
rma.background.correct()所属R语言包:preprocessCore
RMA Background Correction
RMA背景校正
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Background correct each column of a matrix
背景纠正矩阵的每一列
用法----------Usage----------
rma.background.correct(x,copy=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
A matrix of intensities where each column corresponds to a chip and each row is a probe.
芯片和每行每列对应的强度矩阵是一个探针。
参数:copy
Make a copy of matrix before background correctiong. Usually safer to work with a copy, but in certain situations not making a copy of the matrix, but instead background correcting it in place will be more memory friendly.
请背景correctiong前一个矩阵的副本。一般安全工作的一个副本,但在某些情况下,不使矩阵的副本,而是背景纠正到位,将更多的内存友好。
Details
详情----------Details----------
Assumes PMs are a convolution of normal and exponentional. So we observe X+Y where X is backround and Y is signal. bg.adjust returns E[Y|X+Y, Y>0] as our backround corrected PM.
假设项目经理是一个正常和exponentional的卷积。因此,我们观察到X + Y键,其中X为底色和Y信号。 bg.adjust回报Ë[Y | X + Y键,y> 0]作为我们的底色校正时。
值----------Value----------
A RMA background corrected matrix.
一个RMA背景纠正matrix。
作者(S)----------Author(s)----------
Ben Bolstad, <a href="mailto:bmbolstad.com">bmbolstad.com</a>
参考文献----------References----------
Oligonucleotide Array Data: Background, Normalization and Summarization. PhD Dissertation. University of California, Berkeley. pp 17-21
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注:
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