R语言 PREDA包 PREDAResultsGetObservedFlags()函数中文帮助文档(中英文对照)

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PREDAResultsGetObservedFlags(PREDA)
PREDAResultsGetObservedFlags()所属R语言包：PREDA

                                         extract genomic positions with significant alterations as a matrix of flags from a PREDAResults object
                                         作为一个标志矩阵中提取基因位置从PREDAResults对象的显着改变

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

extract genomic positions with significant alterations as a matrix of flags from a PREDAResults object
作为一个标志矩阵中提取基因位置从PREDAResults对象的显着改变


用法----------Usage----------


# PREDAResultsGetObservedFlags(.Object, qval.threshold=0.05,
# smoothStatistic.tail=NULL, smoothStatistic.threshold=NULL,
# null.value=0, significant.value=1)

PREDAResultsGetObservedFlags(.Object, ...)



参数----------Arguments----------

参数：.Object
An object of class PREDAResults or PREDADataAndResults  
一个对象类PREDAResults或PREDADataAndResults，


参数：...
See below     
见下文

qval.threshold: q-value threshold used to identify significant genomic positions   
qval.threshold：Q值阈值用于识别显着的基因位置

smoothStatistic.tail: Possible values are "upper" or "lower". This parameter specify if only one tail of the smoothed statististic distribution must be considered. If it is NULL, both tails are used and smoothStatistic.threshold is ignored.   
smoothStatistic.tail：可能的值是“上”或“低”。此参数指定必须考虑，如果只有一个平滑statististic分布的尾部。如果它是空的，两个尾巴的使用和被忽略smoothStatistic.threshold。

smoothStatistic.threshold: Threshold on smoothStatistic values to select significant genomic regions.   
smoothStatistic.threshold阈值：上smoothStatistic值的选择显着的基因组区域。

null.value: Value (flag) assigned to not significant positions   
null.value：价值（旗），分配到不显著的位置

significant.value: Value (flag) assigned to significant positions      
significant.value：价值（旗）的显着位置

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注：
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