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R语言 PREDA包 PREDAResults2GenomicRegionsSingle()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:25:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
PREDAResults2GenomicRegionsSingle(PREDA)
PREDAResults2GenomicRegionsSingle()所属R语言包:PREDA

                                         identify significant genomic regions from a single analysis in a PREDAResults object
                                         从一个单一的分析确定重大在PREDAResults对象的基因组区域

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

identify significant genomic regions from a single analysis in a PREDAResults object
从一个单一的分析确定重大在PREDAResults对象的基因组区域


用法----------Usage----------


# PREDAResults2GenomicRegionsSingle(.Object,
# qval.threshold=0.05, analysisName=NULL,
# use.referencePositions=TRUE, smoothStatistic.tail=NULL,
# smoothStatistic.threshold=NULL)

PREDAResults2GenomicRegionsSingle(.Object, ...)



参数----------Arguments----------

参数:.Object
Object of class PREDAResults or PREDADataAndResults  
对象类PREDAResults或PREDADataAndResults


参数:...
See below     
见下文

qval.threshold: q-value threshold used to identify significant genomic regions   
qval.threshold:Q值阈值用于识别显着的基因组区域

analysisName: name of the analysis to be considered   
analysisName:名称被视为分析

use.referencePositions: Logical, if TRUE the input reference positions used for PREDA analysis wil be used to identify significant genomic regions boundaries as well.   
use.referencePositions:逻辑,如果真正用于普雷达分析WIL输入参考位置被用来确定以及显著的基因组区域的边界。

smoothStatistic.tail: Possible values are "upper" or "lower". This parameter specify if only one tail of the smoothed statististic distribution must be considered. If it is NULL, both tails are used and smoothStatistic.threshold is ignored.   
smoothStatistic.tail:可能的值是“上”或“低”。此参数指定必须考虑,如果只有一个平滑statististic分布的尾部。如果它是空的,两个尾巴的使用和被忽略smoothStatistic.threshold。

smoothStatistic.threshold: Threshold on smoothStatistic values to select significant genomic regions.      
smoothStatistic.threshold阈值:上smoothStatistic值的选择显着的基因组区域。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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