R语言 PREDA包 GenomicRegionsFromdataframe()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GenomicRegionsFromdataframe(PREDA)
GenomicRegionsFromdataframe()所属R语言包：PREDA

                                         Function to create a GenomiRegions object from a dataframe
                                         函数来创建一个dataframe GenomiRegions对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to create a GenomiRegions object from a dataframe
函数来创建一个dataframe GenomiRegions对象


用法----------Usage----------


GenomicRegionsFromdataframe(GenomicRegions_dataframe, ids_column=NULL, chr_column,
start_column, end_column, chromosomesNumbers=NULL,
chromosomesLabels=NULL, chromosomesLabelsInput=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：GenomicRegions_dataframe
Dataframe object containing the annotations for genomic regions  
dataframe对象包含注释的基因组区域


参数：ids_column
Specify the column from the input dataframe with (optional) ids for genomic regions. Can be specified using column index (numeric) or column name (character).  
指定从输入dataframe的列（可选）的基因组区域的IDS。可以指定使用列索引（数字）或列名（字符）。


参数：chr_column
Specify the column from the input dataframe with chromosome annotations fields. Can be specified using column index (numeric) or column name (character).  
染色体注释字段输入dataframe从指定的列。可以指定使用列索引（数字）或列名（字符）。


参数：start_column
Specify the column from the input dataframe with genomic start position for each genomic region. Can be specified using column index (numeric) or column name (character).  
指定从每个基因组区域的基因组开始位置输入dataframe列。可以指定使用列索引（数字）或列名（字符）。


参数：end_column
Specify the column from the input dataframe with genomic end position for each genomic region. Can be specified using column index (numeric) or column name (character).  
指定从每个基因组区域的基因组末端位置输入dataframe列。可以指定使用列索引（数字）或列名（字符）。


参数：chromosomesNumbers
Numeric vector to specify the list of numeric values to be associated to each chromosome (especially useful for chromosomes not associated to a number such as chr X or Y)  
数字矢量指定数值的列表，要关联到每个染色体（尤其是不相关的一个数，如CHR X或Y染色体）


参数：chromosomesLabels
Character vector to specify the list of character labels to be associated to each chromosome (especially useful for chromosomes not associated to a number such as chr X or Y)  
特征向量来指定要关联到每个染色体（尤其是不相关的一个数，如CHR X或Y染色体的有用字符标签列表）


参数：chromosomesLabelsInput
Character vector to specify the list of character labels  associated to each chromosome in the input. Particularly useful when non numeric character strings are associated to each chromosome in the input file: e.g. "chr3" for chromosome "3".  
特征向量指定每条染色体中输入相关字符的标签列表。非数字字符的字符串时特别有用相关输入文件中的每个染色体例如： “chr3”染色体“3”。


值----------Value----------

An object of class "GenomicRegions"
一个对象的类"GenomicRegions"


作者（S）----------Author(s)----------



Francesco Ferrari




参见----------See Also----------

"GenomicRegions"
"GenomicRegions"

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注：
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