R语言 PREDA包 GenomicRegionsFindOverlap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GenomicRegionsFindOverlap(PREDA)
GenomicRegionsFindOverlap()所属R语言包：PREDA

                                         Function to find overlap between GenomicRegions objects
                                         功能找到GenomicRegions对象之间的重叠

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to find overlap between GenomicRegions objects
功能找到GenomicRegions对象之间的重叠


用法----------Usage----------


GenomicRegionsFindOverlap(GenomicRegions1, GenomicRegions2 = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：GenomicRegions1
Either a GenomicRegions object or a list of GenomicRegions objects  
无论是的GenomicRegions对象或列表GenomicRegions对象


参数：GenomicRegions2
Optiona with default value NULL. Either a GenomicRegions object or a list of GenomicRegions objects.  
optiona与默认值为NULL。无论是的GenomicRegions对象或列表GenomicRegions对象。


Details

详情----------Details----------

Input genomic regions object are compared to select overlapping genomic regions that are returned as GenomicRegions objects.
输入基因组区域的对象进行比较，选择重叠返回GenomicRegions对象的基因组区域。

If two single GenomicRegions object are provided, just one comparison is performed and one single GenomicRegions object is returned.
如果两个单GenomicRegions对象提供的，只是一个比较返回一个单一GenomicRegions对象。

If one single list of GenomicRegions objects is provided as input, then the included GenomicRegions objects are compared to select overlapping GenomicRegions across all of the elements.
如果作为输入提供一个单GenomicRegions对象名单，然后包括GenomicRegions对象进行比较，选择所有元素重叠GenomicRegions。

If two lists of GenomicRegions objects are provided as input, they must have the same number of elements, because element by element comparison will be performed to identify overlapping GenomicRegions across all of the elements.
如果作为输入提供两个GenomicRegions对象名单，他们必须有相同数量的元素，因为元素比较的元素，将所有元素，以确定重叠的GenomicRegions。


值----------Value----------

Either a single GenomicRegions objec or a list of GenomicRegions objecs.
无论是单GenomicRegions物镜或GenomicRegions objecs名单。


作者（S）----------Author(s)----------



Francesco Ferrari




参见----------See Also----------

GenomicRegionsComparison, GenomicRegions
GenomicRegionsComparison，GenomicRegions


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
require(PREDAsampledata)
data(SODEGIRCNanalysisResults)
data(SODEGIRGEanalysisResults)

SODEGIR_GE_UP<-PREDAResults2GenomicRegions(
SODEGIRGEanalysisResults, qval.threshold=0.05,
smoothStatistic.tail="upper", smoothStatistic.threshold=0.5)

SODEGIR_CN_GAIN<-PREDAResults2GenomicRegions(
SODEGIRCNanalysisResults, qval.threshold=0.01,
smoothStatistic.tail="upper", smoothStatistic.threshold=0.1)

SODEGIR_AMPLIFIED<-GenomicRegionsFindOverlap(SODEGIR_GE_UP,
SODEGIR_CN_GAIN)


## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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