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R语言 PREDA包 GenomicAnnotationsFromLibrary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:23:10 | 显示全部楼层 |阅读模式
GenomicAnnotationsFromLibrary(PREDA)
GenomicAnnotationsFromLibrary()所属R语言包:PREDA

                                         Function extracting a GenomicAnnotations object from a Bioconductor annotation library
                                         正常提取1 GenomicAnnotations对象来自Bioconductor注释库

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function extracting a GenomicAnnotations object from a Bioconductor annotation library
正常提取1 GenomicAnnotations对象来自Bioconductor注释库


用法----------Usage----------


GenomicAnnotationsFromLibrary(annotLibrary, probeIDs = NULL,
retain.chrs = NULL, optionalAnnotations = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:annotLibrary
Character string containing the name of the annotations library to be used for building the GenomicAnnotations object  
字符串包含注释库的名称为建设GenomicAnnotations使用对象


参数:probeIDs
Optional: list of reference id from the selected annotLibrary to be used for building the GenomicAnnotations object  
可选:从选定annotLibrary参考ID列表用于建设GenomicAnnotations对象


参数:retain.chrs
Numeric vector, containing the list of chromosomes selected for the output GenomicAnnotations object. E.g. set retain.chrs=1:22 to limit the GenomicAnnotations object to chromosomes from 1 to 22. This might be ueseful to limit GenomiAnnotations objects to autosomic chromosomes.  
数字向量,列表中包含的为输出GenomicAnnotations对象选择的染色体。例如设置retain.chrs = 1时22分,以限制GenomicAnnotations对象从1到22条染色体。这限制GenomiAnnotations的对象autosomic染色体可能是ueseful。


参数:optionalAnnotations
Character vector to select additional annotations fields to be included into the GenomicAnnotations object.  
被列入到GenomicAnnotations对象的特征向量来选择额外的注释字段。


值----------Value----------

An object of class "GenomicAnnotations"
一个对象的类"GenomicAnnotations"


作者(S)----------Author(s)----------



Francesco Ferrari




参见----------See Also----------

"GenomicAnnotations"
"GenomicAnnotations"


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]

GEGenomicAnnotations<-GenomicAnnotationsFromLibrary(annotLibrary=
"org.Hs.eg.db", retain.chrs=1:22)

# with optional annotations Genesymbols and EntrezGeneIDs[与可选的注解Genesymbols和EntrezGeneIDs]
GEGenomicAnnotations<-GenomicAnnotationsFromLibrary(annotLibrary=
"gahgu133plus2.db", retain.chrs=1:22,
optionalAnnotations=c("SYMBOL", "ENTREZID"))



## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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