R语言 prada包 readFCS()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readFCS(prada)
readFCS()所属R语言包：prada

                                        Read an FCS file
                                         读取FCS文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read one or several FCS files: Data File Standard for Flow
阅读：一个或几个FCS的文件流数据文件标准


用法----------Usage----------


  read.fcs(filename=NULL, objectModel="prada", ...)
  readFCS(filename)



参数----------Arguments----------

参数：filename
Character of length 1: filename
字符长度为1：文件名


参数：objectModel
Character of length 1: the object model to use for the output. Curently only 'prada' for cytoFrame objects is supported.
字符长度为1：输出使用的对象模型。 curently只有“普拉达”cytoFrame支持对象。


参数：...
Arguments that get passed on to higher-level import functions. </table>
参数被传递到更高级别的导入功能。 </ TABLE>


Details

详情----------Details----------

The function readFCS works with the output of the FACS machine software from a number of vendors. However, the FCS 3.0 standard includes some options that are not yet implemented in this function. If you need extensions, please let me know. The output of the fucntion is an object of class cytoFrame.
与流式单元仪机软件厂商输出的功能readFCS。然而，FCS 3.0标准包括一些尚未实现此功能的选项。如果您需要扩展，请让我知道。 fucntion输出类cytoFrame的对象。

read.fcs is a wrapper function that allows the user to specify the class of the output. The purpose of the function is to standardize the way flow cytometry data is imported into R using the prada package. If the filename argument to read.fcs is a character vector of length > 1, multiple FCS files can be imported. Please see the documentation for readCytoSet for alternatives ways to import multiple FCS files and for more details on the higher-level import function.
read.fcs是一个包装的功能，允许用户指定输出类。该函数的目的是规范流式单元仪数据导入到Rprada包的方式。如果filename参数read.fcs的length > 1的特征向量，可以导入多个FCS的文件。请看到readCytoSet替代方法导入多个FCS的文件和有关的更高级别的导入功能的更多细节的文档。

For specifications of FCS 3.0 see http://www.isac-net.org and the file ../doc/fcs3.html in the doc directory of the package.
FCS的3.0规格，http://www.isac-net.org和doc包目录中的文件.. / doc/fcs3.html的。


值----------Value----------

An object of class cytoFrame.
对象类cytoFrame。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber <a href="http://www.ebi.ac.uk/huber">http://www.ebi.ac.uk/huber</a>, Florian Hahne



参见----------See Also----------

readCytoSet
readCytoSet


举例----------Examples----------


sampdat <- readFCS(system.file("extdata", "fas-Bcl2-plate323-04-04.A01",
                               package="prada"))
files <- dir(system.file("extdata", package="prada"),
             pattern="[A-H][0-9][0-9]")
sampdat2 <- read.fcs(system.file("extdata", "fas-Bcl2-plate323-04-04.A01",
                               package="prada"))
sampdat3 <- read.fcs(files, path=system.file("extdata", package="prada"))
sampdat
exprs(sampdat[1:3,])
description(sampdat)[3:6]
class(sampdat3)

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注：
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