R语言 prada包 readCytoSet()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readCytoSet(prada)
readCytoSet()所属R语言包：prada

                                        Create a cytoSet object from one or more FCS 3.0 files
                                         1 cytoSet对象创建一个或多个FCS的3.0文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create a cytoSet object from one or more FCS 3.0 files
1 cytoSet对象创建一个或多个FCS的3.0文件


用法----------Usage----------


  readCytoSet(files=NULL, path=".", pattern=NULL, phenoData, sep="\t", ...)



参数----------Arguments----------

参数：files
Optional character vector with filenames
可选的特征向量与文件名


参数：path
Directory where to look for the files
目录中寻找文件


参数：pattern
This argument is passed on to dir (see details).  
这种说法被传递到dir（见详情）。


参数：phenoData
Either an object of class phenoData or  character.
无论是一个对象类phenoData或character。


参数：sep
Separator character that gets passed on to read.AnnotatedDataFrame.
分隔符，被传递到read.AnnotatedDataFrame。


参数：...
Further arguments that get passed on to read.AnnotatedDataFrame, see details.
进一步的参数被传递到read.AnnotatedDataFrame，看到的细节。


Details

详情----------Details----------

There are three different ways to specify the file names:
有三种不同的方式来指定文件名：

First, if the argument phenoData is present and is of class AnnotatedDataFrame, then it is obtained from its column name. The column is mandatory, and an error will be generated if it is not there.  Alternatively, the argument phenoData can be of class character, in which case this function tries to read a AnnotatedDataFrame object from the file with that name by calling read.AnnotatedDataFrame with arguments file.path(path, phenoData), ....
首先，如果参数phenoData是目前类AnnotatedDataFrame，然后得到其列name。列是强制性的，如果它不存在，将会产生一个错误。另外，参数phenoData类character，在这种情况下，这个函数试图读取该名称的文件AnnotatedDataFrame对象调用read.AnnotatedDataFrame与参数file.path(path, phenoData), ...。

Second, if the argument phenoData is not present and the argument files is not NULL, then files is expected to be a character vector with the file names.
其次，如果参数phenoData是不存在的说法files非NULL，则files预计将与文件名的特征向量。

Third, if neither the argument phenoData is present nor files is not NULL, then the file names are obtained by calling   dir(path, pattern).
第三，如果既不参数phenoData现在也不files非NULL，然后文件名调用dir(path, pattern)获得。


值----------Value----------

An object of class cytoSet.
对象类cytoSet。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber <a href="http://www.ebi.ac.uk/huber">http://www.ebi.ac.uk/huber</a>



参见----------See Also----------

readFCSdata
readFCSdata


举例----------Examples----------


## Please see man page for cytoSet-class[＃请参阅手册页为cytoSet级]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。