R语言 prada包 gate-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

gate-class(prada)
gate-class()所属R语言包：prada

                                        'gate': a class for subsetting flow-cytometry data by defining
                                         门：一类流式单元仪数据子集定义

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

In flow-cytometry analysis, regions in two-dimensional projections of the data space often have to be selected. Objects of
在流式单元仪分析，在两维数据空间预测的区域经常有被选中。对象


创建对象----------Creating Objects----------

Objects can be created using methods of the generic function  drawGate or via<br>   new("gate",<br>     gateFun = ....,   # function returning logical vector<br>     colnames = .... # object of class character and length 2<br>     logic = ....  # object of class character<br>   )<br>
通用功能的drawGate或通过参考  new("gate",参考    gateFun = ....,   # function returning logical vector参考    colnames = .... # object of class character and length 2参考    logic = ....  # object of class character<的使用方法可以创建对象BR>  )参考


插槽----------Slots----------


方法----------Methods----------




applyGate: applyGate(x, data) applies the gating of object x on data objects of class cytoFrame or matrix. In the former case x may be of class gate, gateSet, character, numeric or
applyGate：applyGate(x, data)适用对象门x类的数据对象cytoFrame或matrix。在前者情况下x类gate，gateSet，character，numeric或可能




show display summary.
显示显示摘要。




names, names<- access and replace slot name.
姓名，名称< - 访问和更换插槽的名称。




as.gateSet Convert gate object to  gateSet
as.gateSet转换gate gateSet对象的




combineGates Combine multiple gate objects to
combineGates结合多个gate对象




lines Draw the boundaries of the gate.
线条绘制门的界限。


作者（S）----------Author(s)----------


Florian Hahne



参见----------See Also----------

cytoFrame, gateSet
cytoFrame，gateSet


举例----------Examples----------


sampdat <- readFCS(system.file("extdata", "fas-Bcl2-plate323-04-04.A01",
                               package="prada"))
g1 <- new("gate", name="test1", gateFun=function(x)x[,"FSC-H"]<500, logic="&amp;",
          colnames="FSC-H", type="misc")
g1
g2 <- new("gate", name="test2", gateFun=function(x)x[,"SSC-H"]>800, logic="&amp;",
          colnames="SSC-H", type="misc")
gs1 <- combineGates(g1,g2)
gs2 <- as.gateSet(g2)
names(g1)
names(g1) <- "testName"
applyGate(sampdat, g1)
applyGate(exprs(sampdat), g2)
gate(sampdat) <- g1
applyGate(sampdat, 1)
applyGate(sampdat, "testName")
applyGate(sampdat, TRUE)

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