fitNorm2(prada)
fitNorm2()所属R语言包:prada
Fit bivariate normal distribution.
适合二元正态分布。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Fits a bivariate normal distribution into a data set of paired values and selects data points according to their standard deviation from the fitted distribution.
二元正态分布适合进入配对值的数据集,并选择数据点,根据他们从拟合分布的标准偏差。
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:x
Numeric vector containing x-value or n by 2 matrix containing x and y values or object of class cytoFrame.
2矩阵包含x和y的值或对象类cytoFramex值或n数字向量。
参数:y
Numeric vector containing y-value (optional). The length of x must be the same as that of y.
数字向量的y值(可选)。 x长度必须是作为y相同。
参数:scalefac
Numeric vector giving factor of standard deviations used for data selection (all points within scalefac standard deviations are selected).
数值向量提供用于数据选择(scalefac标准差选择范围内的所有点)的标准偏差的因素。
参数:method
One of covMcd or cov.rob defining method used for computation of covariance matrix.
covMcd或cov.rob定义用于计算协方差矩阵的方法之一。
参数:noise
Numeric or logical index vector defining value pairs in x that are not used for fitting of distributions. Can be used to deal with noisy data.
分布拟合不使用X值对数字或逻辑索引向量定义。可以用来处理噪声数据。
参数:gateName
Character giving the name of the gate object.
性格给门对象的名称。
Details
详情----------Details----------
Computes the densities of a bivariate normal distribution from the covariance matrix of the paired data. Covariance matrices are acquired either by function covMcd (considerably faster) or by function cov.rob.
成对数据的协方差矩阵的二元正态分布的计算密度。要么被收购协方差矩阵函数covMcd(相当快)或功能cov.rob。
值----------Value----------
A list containing items mu (midpoint of distribution), S (covariance matrix), p (density values for each data pair), sel (selection of data points), scalefac (factor of standard deviations used for data selection), data (x and y values of data points) and gate, an object of class
一个列表,其中包含项目mu(分配的中点),S(协方差矩阵),p(每个数据对密度值),sel(选择数据点) scalefac(用于选择数据的标准偏差的因素),data(X和Y值的数据点)和gate,一个类的对象
作者(S)----------Author(s)----------
Florian Hahne
参见----------See Also----------
cov.rob, covMcd,
cov.rob,covMcd
举例----------Examples----------
sampdat <- readFCS(system.file("extdata",
"fas-Bcl2-plate323-04-04.A01", package="prada"))
nfit <- fitNorm2(exprs(sampdat[,1:2]), scalefac=2)
plotNorm2(nfit, selection=TRUE, ellipse=TRUE)
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