R语言 ppiStats包 nullDistDoublyTestedEdges()函数中文帮助文档(中英文对照)

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nullDistDoublyTestedEdges(ppiStats)
nullDistDoublyTestedEdges()所属R语言包：ppiStats

                                        Null distribution of number of reciprocated,
                                         空分布投桃报李数，

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculate the null distribution of the number of reciprocated, unreciprocated and missing edges in a stochastic model where each edge is tested twice.
空分布计算，其中每条边两次测试中的随机模型投桃报李，unreciprocated的和丢失的边缘。


用法----------Usage----------


nullDistDoublyTestedEdges(deltaMax, n, pFP, pFN)



参数----------Arguments----------

参数：deltaMax
Integer. Distributions will be calculated for model parameter delta=0, 1, 2, ..., deltaMax.
整数。将计算分布模型参数Delta=0, 1, 2, ..., deltaMax。


参数：n
Integer. The parameter n of the model.
整数。该模型的参数n。


参数：pFP
Numeric. The parameter pFP of the model.
数字。该模型的参数亲民党。


参数：pFN
Numeric. The parameter pFN of the model.
数字。该模型的参数PFN。


Details

详情----------Details----------

The model is described in the vignette Stochastic and systematic errors in PPI data, by looking at unreciprocated in- or out-edges by W. Huber, T. Chiang and R. Gentleman.
模型中描述的小品文随机和PPI数据的系统误差，通过寻找在unreciprocated，或由T.江和河君子·胡贝尔，出边。

This function can be quite slow, its runtime grows quickly with deltaMax (and is roughly independent of n, pFP, pFN). The example below should take only a few seconds on a reasonable computer, though.
此功能可以是相当缓慢，其运行快速增长deltaMax（大约是独立的n，pFP，pFN）。下面的例子中应采取合理的计算机上，虽然只有几秒钟。


值----------Value----------

3d array with dimensions nMax+1 x nMax+1 x deltaMax+1 whose element p[nr+1, nu+1, delta+1] is the corresponding joint probability.  nMax+1 is calculated (probably too conservatively) by the function to make sure that no probability leaks out of the array.
同尺寸的3D阵列nMax+1XnMax+1XdeltaMax+1元素p[nr+1, nu+1, delta+1]是相应的联合概率。 nMax+1计算功能（可能过于保守），以确保无的概率泄漏的阵列。


作者（S）----------Author(s)----------


Wolfgang Huber <a href="http://www.ebi.ac.uk/huber">http://www.ebi.ac.uk/huber</a>



举例----------Examples----------


p = nullDistDoublyTestedEdges(32, 1000, pFP=0.001, pFN=0.15)

if(interactive() &amp;&amp; require("RColorBrewer"))
  for(k in 1:dim(p)[3]) {
    image(sqrt(p[,,k]), xlab=expression(N[rec]), ylab=expression(N[unrec]),
        main = expression(P(N[rec], N[unrec]~";"~ delta^"*", n, p[FP], p[FN])),
        x = 1:dim(p)[1], y = 1:dim(p)[2],
        col = colorRampPalette(brewer.pal(9, "GnBu"))(256))
    text(35, 35, paste("delta", k, sep="="))
  }

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