R语言 ppiStats包 hgTests()函数中文帮助文档(中英文对照)

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hgTests(ppiStats)
hgTests()所属R语言包：ppiStats

                                        A wrapper function to implement the Hypergeometric test,  
                                         一个包装函数来实现超几何测试，

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes the instances of the hyperGParams and conducts a (conditional) test for over/under representation of some category under the Hypergeometric distribution.
此功能需要的hyperGParams实例，并进行上/下某些类别下的超几何分布的代表性（有条件的）测试。


用法----------Usage----------


ppiHGTest4GO(parameter, filename, append=TRUE,
                      label = "Experiment name here",
                      typeGeneSet = "Describe the gene set here",
                      cs=50)

ppiHGTest4PFAM(parameter, filename, append = TRUE,
                           label = "Experiment Name Here",
                           typeGeneSet = "Describe the Gene Set Here",
                           cs = 50)



参数----------Arguments----------

参数：parameter
An object of hyperGParams.
对象的hyperGParams。


参数：filename
A character vector. The name given to the .html file produced.
字符向量。生产。html文件的名称。


参数：append
A logical. If multiple tests are conducted using the same filename, then the  .html file will be appended if TRUE or over-written if FALSE.
一个逻辑。如果有多个测试使用相同的文件名，然后被追加。html文件，如果为TRUE或以上书面如果为FALSE。


参数：label
A character. The should give a description of the experiment used to  obtain the gene set.
一个字符。应该给用于实验获得的基因组的描述。


参数：typeGeneSet
A character: this character vector should adequately describe the gene set itself.
字符：这个特征向量应充分描述基因组本身。


参数：cs
A numeric. This gives a cut-off for the size of the categories in which we  conduct the test.
一个数字。这使得截断的大小，在我们进行测试的类别。


值----------Value----------

A instance of the class hyperGTest as well as an .html file.
一类hyperGTest以及一个。html文件的实例。


作者（S）----------Author(s)----------


T Chiang

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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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