R语言 plateCore包 fixAutoFl()函数中文帮助文档(中英文对照)

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fixAutoFl(plateCore)
fixAutoFl()所属R语言包：plateCore

                                        Correct for the effects of cell size (FSC) on autofluorescence
                                         纠正对自体荧光的单元大小（FSC）的影响

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The fixAutoFl function uses the method of Hahne et al. 2006 (Genome Biology) to fit a robust, log-log linear regression to the fluorescence channel of interest versus forward scatter (FSC).  The current implementation scales the corrected data so the median fluorescence intensity (MFI) is the same before and after fixAutoFl.
fixAutoFl功能使用的Hahne等方法。 2006年（基因组生物学），以适应一个强大的，线性回归的log-log的利益与前向散射（FSC）的荧光通道。当前实施规模修正后的数据，这样的平均荧光强度（MFI）是相同的，前，后fixAutoFl。


用法----------Usage----------


fixAutoFl(fp,fsc="FSC.A",chanCols,unstain,...)



参数----------Arguments----------

参数：fp
A flowPlate  
一个flowPlate


参数：chanCols
Selected channels to correct for autofluorescence.  
选择修正为自体荧光的渠道。


参数：unstain
Name(s) of the unstained samples. The function will try to find samples with Sample.Type="Unstained" if no names are given. If there are multiple unstained samples the function will average the slopes.  
（S）的未染色的样品。该函数将尝试找到Sample.Type =“不染”的样本，如果没有名称。如果有多个未染色样品的功能将平均斜坡。


参数：fsc
Name of the FSC parameter.  
FSC参数的名称。


参数：...
optional arguments
可选参数


值----------Value----------

Returns a flowPlate with autofluorescence due to cell size (FSC) corrected.
返回一个与自体荧光flowPlate由于单元大小（FSC）的纠正。


作者（S）----------Author(s)----------


Errol Strain



举例----------Examples----------


library(plateCore)
data(plateCore)

## Get the lymphocytes[＃获取淋巴单元]
rectGate <- rectangleGate("FSC-H"=c(300,700),"SSC-H"=c(50,400))
pbmcPlate <- Subset(pbmcPlate, rectGate)

## Create a flowPlate object from the platePBMC and the wellAnnotation[＃创建一个从“platePBMC flowPlate对象的wellAnnotation]
fp <- flowPlate(pbmcPlate,wellAnnotation,plateName="P1")

## Correct for autofluorescence in FL1.H-FL4.H[＃正确的自体荧光为在FL1.H FL4.H]
fp <- fixAutoFl(fp,fsc="FSC-H",chanCols=c("FL1-H","FL2-H","FL3-H","FL4-H"))

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