densityplot(plateCore)
densityplot()所属R语言包:plateCore
One-dimensional density plots for flowPlates
flowPlates为一维密度图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function is a modified version of densityplot from the flowViz package that allows for multiple flowFrames per panel. flowViz densityplot plots the density curves in a one per panel style, while the flowPlate densityplot can overlay densities.
这个函数是从flowViz包的版本,它允许多个flowFrames每面板densityplot修改。 flowViz densityplot图的密度曲线,在每一个面板风格,而flowPlate densityplot可以覆盖密度。
用法----------Usage----------
## S4 method for signature 'formula,flowPlate'
densityplot(x, data, xlab,
prepanel=prepanel.densityplot.flowPlate,
panel = panel.densityplot.flowPlate,
as.table=TRUE,
filterResult=NULL,
...)
参数----------Arguments----------
参数:x
A formula describing the layout of the plots.
一个公式描述的图的布局。
参数:data
A flowPlate.
一个flowPlate。
参数:xlab
Label for the x-axis
为x轴的标签
参数:prepanel
Lattice-flowViz prepanel function.
的格子flowViz prepanel功能。
参数:panel
Lattice-flowViz panel function.
格flowViz面板功能。
参数:as.table
Defaults to table layout.
默认表布局。
参数:filterResult
filterResult can either take the character string "Negative.Control" and have the negative control wells added to the panels, or if filterResult is a flowFrame then the density curve for the flowFrame will be added to each panel.
要么filterResult可以采取字符串“Negative.Control的”和阴性对照井添加到面板,或如果filterResult flowFrame,然后为flowFrame密度曲线将被添加到每个小组。
参数:...
optional arguments
可选参数
参见----------See Also----------
flowViz::densityplot
flowViz::densityplot
举例----------Examples----------
# Load the plateCore package and data[加载plateCore包和数据]
library(plateCore)
data(plateCore)
# Create a flowPlate from the sample data in plateCore[从在plateCore的样本数据,创建1 flowPlate]
fp <- flowPlate(pbmcPlate,wellAnnotation,plateName="P1")
# Overlay the first 3 flowFrames. If the groups argument was[叠加3 flowFrames。如果该组参数]
# omitted, then the flowFrames would be combined into a single[省略,则flowFrames将合并成一个单一]
# density curve.[密度曲线。]
densityplot(~ `FSC-H`, fp[1:3], groups=name, auto.key=TRUE)
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