R语言 plateCore包 applyControlGates()函数中文帮助文档(中英文对照)

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applyControlGates(plateCore)
applyControlGates()所属R语言包：plateCore

                                         Apply control gates to a flowPlate
                                         应用控制大门到flowPlate

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Once setControlGates has been used to create gates for a flowPlate object, gates are applied to test samples using applyControlGates. The applyControlGates function is separated from setControlGates since gates may need be changed outside of setControlGates.  
一旦setControlGates已被用于盖茨创建为flowPlate对象，门都适用于测试样品使用applyControlGates。 applyControlGates功能是从setControlGates分开，因为门可能需要改变外setControlGates。


用法----------Usage----------


applyControlGates(data, gateType="Negative.Control", ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
A flowPlate dataset.  
一个flowPlate集。


参数：gateType
The type of gate to be applied to the flowPlate. Currently only "Negative.Control" gates are supported.  
门式应用的flowPlate。目前只有“Negative.Control”盖茨支持。


参数：...
optional arguments
可选参数


值----------Value----------

Returns a flowPlate where the wellAnnotation now contains additional  columns corresponding to total number of events in a well (Total.Count), the percentage of cells above background (Percent.Positive), and the number of positive cells (Positive.Count).
返回一个flowPlate现在wellAnnotation包含额外列相应总数（Total.Count）在一个良好的事件，在上述背景下的单元百分比（Percent.Positive），阳性单元数（Positive.计数）。


作者（S）----------Author(s)----------


Errol Strain



参见----------See Also----------

See Also setControlGates
另见setControlGates


举例----------Examples----------


library(plateCore)
data(plateCore)

## Get the lymphocytes[＃获取淋巴单元]
rectGate <- rectangleGate("FSC-H"=c(300,700),"SSC-H"=c(50,400))
pbmcPlate <- Subset(pbmcPlate, rectGate)

# Create a flowPlate from the sample data in plateCore[从在plateCore的样本数据，创建1 flowPlate]
fp <- flowPlate(pbmcPlate,wellAnnotation,plateName="P1")

# Create a set of negative control gates and then apply them[创建了一套负控制闸门，然后将它们应用]
fp <- setControlGates(fp,gateType="Negative.Control")
fp <- applyControlGates(fp,gateType="Negative.Control")

# Percent Positive and Counts columns are now in the wellAnnotation[现在在wellAnnotation％的正和计数列]
head(wellAnnotation(fp))


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