R语言 PICS包 setParaEM()函数中文帮助文档(中英文对照)

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setParaEM(PICS)
setParaEM()所属R语言包：PICS

                                        Set convergence parameters of the EM algorithm
                                         设置EM算法的收敛参数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be used to change the internal PICS parameters for the EM algorithm. This function should only be called if you really now what you are doing!.
此功能可以用来改变内部的PICS EM算法的参数。此功能只应称为“如果你真的现在你正在做的！


用法----------Usage----------


setParaEM(minK=1,maxK=15,tol=1e-4,B=100,mSelect="BIC",mergePeaks=TRUE,mapCorrect=TRUE,dataType="TF")



参数----------Arguments----------

参数：minK
An integer value. The minimum number of binding events per region.
一个整型值。结合每个区域发生的事件的最低数量。


参数：maxK
An integer value. The maximum number of binding events per region.
一个整型值。结合每个区域发生的事件的最大数量。


参数：tol
The tolerance for the EM algorithm
EM算法的公差


参数：B
An integer value. The maximum number of iterations to be used.
一个整型值。要使用迭代的最大数量。


参数：mSelect
A character string specifying the information criteria to be used when selecting the number of binding events.
一个字符串，指定选择绑定事件时要使用的信息标准。


参数：mergePeaks
A logical value stating whether overlapping binding events should be picked.
应抱起一个逻辑值是否重叠结合的事件说明。


参数：mapCorrect
Should mappability profiles be incorporated in the estimation, that is missing reads estimated.
应该被纳入估计mappability型材，缺少读取估计。


参数：dataType
A character string equal to either "H" or "TF", "H" for histone and "TF" for transcription factors.
一个字符串等于无论是“H”或“的TF，轰的组蛋白和的TF”的转录因子。


值----------Value----------

No value returned. The function simply modifies the internal variables "paraEMTF" if dataType='TF' and "paraEMH" if dataType='H'.
没有返回值。功能简单修改内部变量paraEMTF“如果dataType =的TF和paraEMH如果dataType =”H“。


作者（S）----------Author(s)----------


Xuekui Zhang, Arnaud Droit &lt;<a href="mailto:arnaud.droit@crchuq.ualaval.ca">arnaud.droit@crchuq.ualaval.ca</a>&gt; and Raphael Gottardo &lt;<a href="mailto:rgottard@fhcrc.org">rgottard@fhcrc.org</a>&gt;



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

setParaPrior
setParaPrior


举例----------Examples----------


# Using mSelect="BIC"[使用mSelect =“BIC的”]
setParaEM(minK=1,maxK=15,tol=1e-4,B=100,mSelect="BIC",mergePeaks=TRUE,mapCorrect=TRUE,dataType="TF")
# Using mSelect="AIC"[使用mSelect =“工商局”]
setParaEM(minK=1,maxK=15,tol=1e-4,B=100,mSelect="AIC",mergePeaks=TRUE,mapCorrect=TRUE,dataType="TF")

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