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R语言 PGSEA包 writeGmt()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 11:01:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
writeGmt(PGSEA)
writeGmt()所属R语言包:PGSEA

                                         writeGmt
                                         writeGmt

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function writes out SMC objects into .gmt file format
这个函数写的SMC对象GMT文件格式。


用法----------Usage----------


writeGmt(fname, cl)



参数----------Arguments----------

参数:fname
name of the file to be written out  
被写入的文件的名称


参数:cl
list of SMC objects  
校董对象名单


Details

详情----------Details----------

The .gmt file format is a tab delimited file format used to store gene lists. These gene lists are stored row by row. The first column is the gene set name. The second column is a brief description, and every entry after that is a gene within that gene set.
文件格式。GMT是一个制表符分隔的文件格式,用于存储基因名单。这些基因列表存储鳞次栉比。第一列是基因组的名称。第二列是一个简短的描述,每一个条目后,这是一个基因,基因组内。


作者(S)----------Author(s)----------


Kyle Furge <kyle.furge@vai.org> and Karl Dykema <karl.dykema@vai.org>



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------



        datadir <- system.file("extdata", package = "PGSEA")
        sample <- readGmt(file.path(datadir, "sample.gmt"))
        str(sample)

## Not run: [#无法运行:]
        writeGmt(paste(datadir,"/output.gmt",sep=""),sample)

## End(Not run)[#结束(不运行)]



转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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