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KastenmayerRaw(PCpheno)
KastenmayerRaw()所属R语言包：PCpheno

                                        Data from Kastenmayer et al. 2006
                                         从Kastenmayer等数据。 2006年

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Kastenmayer et al. (2006) undertook the first functional studies of small open reading frames (sORFs) in any system, using the model eukaryote Saccharomyces cerevisiae. Phenotypic analyses of the new gene-deletion strains identified 22 sORFs required for haploid growth, growth at high temperature, growth in the presence of a non-fermentable carbon source, or growth in the presence of DNA damage and replication-arrest agents.   
kastenmayer等人。 （2006年）在任何系统进行小的开放阅读框（sORFs）功能的研究，使用的模型真核生物酵母。新的基因缺失株的表型分析，确定为的单倍体增长，增长中存在的非发酵碳源，或成长中存在的DNA损伤和复制逮捕剂在高温下生长，需要22 sORFs。


用法----------Usage----------


data(KastenmayerRaw)



格式----------Format----------

Kastenmayer is a 5 columns dataframe.
Kastenmayer是5列dataframe的。




SYSTEMATIC Systematic name of the sORF.
系统的系统名称的sORF。




COMMUN Commun name of the sORF.
COMMUN的sORF COMMUN名。




Length Length of the small ORF sequence in number of amino acids.
小ORF氨基酸序列的长度长度。




Evidence Experimental source of the data
实验证据源数据




refHomology Bibliographical evidence of reported homology.
refHomology书目报道的同源性的证据。




Kocollection Bibliographical evidence of reported homology.
kocollection书目报道的同源性的证据。




ESSENTIAL Indicates if the sORF knockout is essential.  A
要指示，如果sORF淘汰赛是必不可少的。一




GFPTAP "GFP" or "TAP" signifies that sORF was detected by the indicated technique. "both" indicates that sORF was detected both as a TAP-tagged and GFP-tagged protein.  "None" indicates
GFPTAP“绿色荧光蛋白”或“龙头”，标志着，sORF由指定的技术检测。 “既”表示sORF自来水标签和GFP标记的蛋白质检测。 “无”表示




UPTAG Sequence of the upstream primer.
UPTAG上游引物序列。




DOWNTAG Sequence of the downstream primer.
DOWNTAG下游引物序列。


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



源----------Source----------

Kastenmayer et al. (2006), supplementary information: http://www.genomeresearch.org or  ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/systematic_results/phenotypes
kastenmayer等人。 （2006年），补充资料：http://www.genomeresearch.org或ftp://genome-ftp.stanford.edu/pub/yeast/systematic_results/phenotypes


参考文献----------References----------

Davis RW, Boeke JD, Snyder MA, Basrai MA. (2006) Functional genomics of genes with small open reading frames (sORFs) in S. cerevisiae. Genome Res. 16(3):365-73. PMID: 16510898

举例----------Examples----------


data(KastenmayerRaw)
str(KastenmayerRaw)

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