R语言 PCpheno包 gtResult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gtResult-class(PCpheno)
gtResult-class()所属R语言包：PCpheno

                                        A class for representing the result of a graphTheory test.
                                         A类代表一个graphTheory测试结果。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class for representing the result of a graphTheory test.
A类代表graphTheory测试结果的。


插槽----------Slots----------




Pvalue: Object of class "numeric"
Pvalue类"numeric"：对象




Observed: Return a "numeric" vector: the observed  number of interactions between genes inducing a specific phenotype and each
Observed：返回一个"numeric"向量诱导特定的表型和每个基因之间的相互作用观测




Expected: Return a matrix: the expected number of interactions between genes inducing a specific phenotype and each
Expected：返回一个矩阵：预期的相互作用诱导一个特定的表型和每个基因之间的数


延伸----------Extends----------

Class "testResult", directly.
类"testResult"，直接。


方法----------Methods----------




plot Graphical representation of the test result
plot测试结果的图形表示


作者（S）----------Author(s)----------


N. LeMeur



参见----------See Also----------

testResult,deResult,plot
testResult，deResult，plot


举例----------Examples----------


## apply a densityEstimate test [＃套用densityEstimate测试。]
data(DudleyPhenoM)
data(ScISIC)

DudleyPhenoL <- apply(DudleyPhenoM,2,function(x) names(which(x==1)))
NaCl <- DudleyPhenoL[["NaCl"]]

perm <- 20
NaClGraph <- graphTheory(genename=NaCl, interactome=ScISIC,
perm=perm)


## access results[＃访问结果]
slotNames(NaClGraph)
NaClGraph@Pvalue[1:5]

## use of the plot method[＃使用的图方法]
plot(NaClGraph)

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注：
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