cosineSim(PAN)
cosineSim()所属R语言包:PAN
Compute cosine similarities or distances between pairs of genes
计算余弦相似性或对基因之间的距离
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function compute cosine similarities or distances between pairs of genes, given measured rich phenotypes.
这个函数的计算余弦相似性或对基因之间的距离,测量丰富的表型。
用法----------Usage----------
cosineSim(x)
cosineDist(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
a numeric matrix of rich phenotypes with rows and columns specifying samples and genes, respectively.
数字矩阵的行和列分别指定样本和基因,丰富的表型。
值----------Value----------
This function will return either a numeric matrix of cosine similarities or an object of dist.
这个函数将返回一个数字的余弦相似性矩阵或dist的对象的。
作者(S)----------Author(s)----------
Xin Wang <a href="mailto:xw264@cam.ac.uk">xw264@cam.ac.uk</a>
参考文献----------References----------
and Florian Markowetz, Posterior association networks and enriched functional gene modules inferred from rich phenotypic perturbation screens, in preparation.
参见----------See Also----------
assoScore
assoScore
举例----------Examples----------
toydata<-matrix(rnorm(n=2000, mean=0, sd=4), nrow=100, ncol=20)
toycossim<-cosineSim(t(toydata))
toycosdist<-cosineDist(t(toydata))
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