R语言 PAnnBuilder包 writeData_DB()函数中文帮助文档(中英文对照)

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writeData_DB(PAnnBuilder)
writeData_DB()所属R语言包：PAnnBuilder

                                        Parse and Write Data into R Data Packages
                                         到R数据包解析和写入数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions store data tables in the "*.sqlite" file in SQLite-based  annotation package.
这些功能存储的数据表中的“*。sqlite的”基于SQLite的注解包文件。


用法----------Usage----------


createEmptyDPkg(pkgName, pkgPath,folders = c("man", "R", "data"), force = TRUE)

writeMeta_DB(db, repList)

writeData_DB(type, srcUrls, db, organism="")
writeSPData_DB(srcUrls, db, organism)
writeIPIData_DB(srcUrls, db, organism)
writeREFSEQData_DB(srcUrls, db, organism)
writeSYSBODYFLUIDData_DB(srcUrls, db)
writeGOAData_DB(srcUrls, db)
writeHomoloGeneData_DB(srcUrls, db)
writeInParanoidData_DB(srcUrls, db)
writeGENEINTData_DB(srcUrls, db)
writeINTACTData_DB(srcUrls, db)
writeMPPIData_DB(srcUrls, db)
write3DIDData_DB(srcUrls, db)
writeDOMINEData_DB(srcUrls, db)
writePeptideAtlasData_DB(srcUrls, db)
writeSYSPTMData_DB(srcUrls, db)
writeSCOPData_DB(srcUrls, db)
writeBACELLOData_DB(srcUrls, db)
writeDBSUBLOCData_DB(srcUrls, db)

writeName_DB(type, srcUrls, db)
writeGOName_DB(srcUrls, db)
writeKEGGName_DB(srcUrls, db)
writePFAMName_DB(srcUrls, db)
writeINTERPROName_DB(srcUrls, db)
writeTAXName_DB(srcUrls, db)



参数----------Arguments----------

参数：pkgName
the name of the data package to be built. (e.g. "hsaSP")  
要建立的数据包的名称。 （例如“hsaSP”）


参数：pkgPath
a character string for the full path of an existing directory where the built backage will be stored.   
为建backage将存储现有目录的完整路径的字符串。


参数：folders
a string vector for the file folder of establish R package.
为建立R包的文件夹的字符串向量。


参数：force
a boolean to indicate whether the existed homonymic folder  will be removed.
一个布尔值，指示是否存在同名文件夹将被删除。


参数：db
a object that extends DBIConnection.
一个对象延伸DBIConnection。


参数：repList
a named list which will replace the symbols in template file.
一个名为列表将取代在模板文件中的符号。


参数：type
character string, giving the name of concerned database.
字符串，提供有关数据库的名称。


参数：srcUrls
a character string, giving the url of the source file.   
一个字符串，使源文件的URL。


参数：organism
a character string for the name of the organism of concern. (eg: "Homo sapiens")
为关注的有机体的名称的字符串。 （例如：“智人”）


Details

详情----------Details----------

These functions download and parse data from diverse databases. The result files are stored as tables in the "*.sqlite" file.
这些功能下载和分析来自不同数据库的数据。结果文件存储为“*。sqlite的”文件中的表。

writeMeta_DB writes information from "repList" into a table  called "metadata".
writeMeta_DB写道“repList”的信息到被称为“元数据”表。

writeData_DB download and parse source file, and write the result files into tables.  
writeData_DB下载并解析源文件，并写入到表中的结果文件。


作者（S）----------Author(s)----------


Hong Li

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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