R语言 OTUbase包 subOTUset()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

subOTUset(OTUbase)
subOTUset()所属R语言包：OTUbase

                                        subOTUset
                                         subOTUset

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to get a subset of an OTUset object.
函数来获取一个OTUset对象的一个子集。


用法----------Usage----------



subOTUset(object, samples, otus)




参数----------Arguments----------

参数：object
An OTUset object
一个OTUset对象


参数：samples
A list of sample names
样品名称列表


参数：otus
A list of OTU names
OTU的名称列表


值----------Value----------

subOTUset returns an OTUset
subOTUset返回一个OTUset


举例----------Examples----------



## locate directory with data[＃定位数据目录]
dirPath <- system.file("extdata/Sogin_2006", package="OTUbase")

## read in data into OTUset object[＃读取数据OTUset对象]
soginOTU <- readOTUset(dirPath=dirPath, level="0.03", samplefile="sogin.groups", fastafile="sogin.fasta", otufile="sogin.unique.filter.fn.list", sampleADF="sample_metadata.txt")

## get subset of soginOTU[＃得到soginOTU子集。]

subOTUset(soginOTU, samples=getSamples(soginOTU, colnum="Site", value="Labrador", exact=FALSE))


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。