R语言 OTUbase包 accessors()函数中文帮助文档(中英文对照)

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accessors(OTUbase)
accessors()所属R语言包：OTUbase

                                        Accessor functions for OTUset and TAXset objects
                                         为OTUset和TAXset对象的存取功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions provide access to some of the slots of OTUset and TAXset objects. otuID returns the otuID slot of OTUset objects. sampleID returns the sampleID slot of both OTUset and TAXset objects. tax and tax<- return and replace the tax slot of TAXset objects.
这些功能提供访问插槽OTUset和TAXset对象。 otuID返回otuID OTUset对象插槽。 sampleID返回sampleID插槽OTUset和TAXset对象。 tax和tax<-返回，并更换了tax的TAXset对象插槽。


用法----------Usage----------


    sampleID(object, ...)
    otuID(object, ...)
    tax(object, ...)
    tax(object)&lt;-value



参数----------Arguments----------

参数：object
An OTUset or a TAXset object
OTUset或TAXset对象


参数：value
The replacement value for tax
tax替换值


参数：...
Added for completeness. Enables the passing of arguments.
新增的完整性。启用参数逝世。


值----------Value----------

sampleID and otuID return a character. tax returns a data.frame.
sampleID和otuID返回一个字符。 tax返回数据框。


参见----------See Also----------

ShortRead
ShortRead


举例----------Examples----------



## locate directory with data[＃定位数据目录]
dirPath <- system.file("extdata/Sogin_2006", package="OTUbase")

## read in data into OTUset object[＃读取数据OTUset对象]
soginOTU <- readOTUset(dirPath=dirPath, level="0.03", samplefile="sogin.groups", fastafile="sogin.fasta", otufile="sogin.unique.filter.fn.list", sampleADF="sample_metadata.txt")

## get the sampleID slot[＃得到sampleID插槽。]
sampleID(soginOTU)

## get the otuID slot[＃得到otuID插槽。]
otuID(soginOTU)


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