ncScaffold(oneChannelGUI)
ncScaffold()所属R语言包:oneChannelGUI
stand alone function to generate a scaffold containing only ncRNA location from ENSEMBL
独立的函数来生成一个支架只包含从ENSEMBL的ncRNA的位置
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The scaffold contains chr stand start and end position of ncRNA. ENSEMBL retrieved spicies are miRNA,Mt_rRNA,Mt_tRNA,rRNA,snoRNA,snRNA
脚手架包含CHR站开始和结束位置ncRNA的。 ENSEMBL检索spicies的miRNA,Mt_rRNA,Mt_tRNA,rRNA基因,snoRNA的,snRNA的
用法----------Usage----------
ncScaffold(genome, fasta)
参数----------Arguments----------
参数:genome
The genome code for H sapiens is hg19, for M musculus is mm9 and for R norvegicus is rn4
为H智人的基因代码是hg19,为M肌MM9是褐家鼠为R RN4
参数:fasta
If fasta is TRUE a fasta file with the sequences retrieved by ncScaffold will be produced
如果是TRUE FASTA与ncScaffold检索序列的FASTA文件将产生
Details
详情----------Details----------
The scaffold is used to map reads data into regions only associated to ncRNAs
脚手架用于图数据读入只关联到非编码RNA的区域
作者(S)----------Author(s)----------
Raffaele A Calogero
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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