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R语言 oneChannelGUI包 mapping2RefSeq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 08:33:46 | 显示全部楼层 |阅读模式
mapping2RefSeq(oneChannelGUI)
mapping2RefSeq()所属R语言包:oneChannelGUI

                                        This function maps on NCBI Reference sequences spliced exons detected by the
                                         此功能图NCBI的参考序列拼接外显子检测

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function retrieve from RRE the PSR sequences associated to the exon-level probe sets using blastn detects the best refseq associated to any of the exon-level probe sets retrieve from org.XX.eg.db the EG associated to any of the detected refseq and retrieves all the refseqs associated to the EG. Subsequently check if PSR maps on all the refseqs associated to the eg (conserved exon) or only some of them (isoform specific exon)
此功能从RRE的检索外显子级探针序列的PSR关联集使用BLASTN检测相关的任何外显子水平探针设置最好的RefSeq检索从任何检测到的RefSeq相关的EG org.XX.eg.db和检索所有相关的EG refseqs。随后检查如果所有的refseqs上的PSR图相关的如他们(保守的外显子),或只有一些(具体亚型外显子)


用法----------Usage----------


mapping2RefSeq()



作者(S)----------Author(s)----------


Raffaele A Calogero

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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