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R语言 oneChannelGUI包 mapping2exon()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 08:33:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
mapping2exon(oneChannelGUI)
mapping2exon()所属R语言包:oneChannelGUI

                                        This function maps on exon-level Probe Selection Region (PSR) starting for the file produced by function
                                         外显子级探针选择区域功能图(PSR)的功能所产生的文件开始

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function retrieve from RRE the PSR sequences associated to the exon-level probe sets and all exons associated to the gene associated to PRS. Subsequently identify the exon  where PSR maps and procuces a  fasta file were are located exon-level PSR and target exon. The mapping is done using the countPattern function of the Biostrings package. Up to three mismathces are allowed in PSR mapping on exonic sequence.
此功能从RRE的检索对PSR关联的外显子探针集和关联到减贫战略相关基因的所有外显子序列。随后找出PSR图和procuces一个FASTA文件分别位于外显子水平的PSR和目标外显子的外显子。映射完成,使用的Biostrings包countPattern功能。外显子序列中的PSR映射允许三个mismathces的。


用法----------Usage----------


mapping2exon()



作者(S)----------Author(s)----------


Raffaele A Calogero

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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