R语言 OLIN包 m2v()函数中文帮助文档(中英文对照)

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m2v(OLIN)
m2v()所属R语言包：OLIN

                                        Converts matrix to vector based on spot layout
                                         根据现场布局转换矩阵向量

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function converts a matrix based on the spatial layout of spots to a vector. Optionally,
此功能转换矩阵的基础上，向量点的空间布局。 （可选）


用法----------Usage----------


m2v(M,Ngc,Ngr,Nsc,Nsr,visu=FALSE,color.lim=c(-1,1),xlab="Columns",ylab="Rows",...)



参数----------Arguments----------

参数：M
Matrix of real values  
实际值的矩阵


参数：Ngc
number of columns for the grid matrix
网格矩阵的列数


参数：Ngr
number of rows for the grid matrix
网格矩阵的行数


参数：Nsc
number of columns for the spot matrix
点矩阵的列数


参数：Nsr
number of rows for the spot matrix
点矩阵的行数


参数：visu
If TRUE, MXY plot is generated.  
如果是TRUE，MXY图产生。


参数：color.lim
limits of colour range for 2D-plot
2D图的色彩范围的限制


参数：xlab
label of x -axis of 2D-plot
二维图x轴的标签


参数：ylab
label of y-axis of 2D-plot
2D图Y轴的标签


参数：...
Further optional parameters  for the image function generating the MXY plot
image功能的进一步可选参数生成MXY图


Details

详情----------Details----------

The function m2v rearranges the values of  a matrix M corresponding to the intensity values on the array  to a vector V. The matrix M may have been generated by e.g. v2m. The order of values in V follows the convention of marrayRaw objects.  In fact, the transformation of m2v is the reverse of v2m (assuming the  arguments are kept the same.) Note that these functions assume a specific mapping between the data points and the location of spot (i.e. the same mapping rule that is used for marrayRaw/marrayNorm objects.) The validity of the mappings should be  carefully checked (see also the documentation of the marray package.)   The option for spatial visualisation is rather restricted to logged fold-changes as the corresponding colour range is centred around zero and follows the conventional colouring (green for negative, red for positive fold-changes). The MXY plot produced by m2v does not include a colour-bar. To have a colour included, mxy.plot can be used.  
功能m2v重新排列值矩阵M相应的磁盘阵列上的强度值矢量V。矩阵M可能已经产生例如v2m。的值V的顺序如下公约marrayRaw对象。事实上，转型是逆向m2vv2m（假设参数均保持不变。）请注意，这些函数假设之间的数据点与点的位置（即特定的映射相同的映射规则为用于marrayRaw / marrayNorm对象）映射的有效性应仔细检查（另见文件的marray包。）空间可视化的选项，而相应的颜色来限制记录倍的变化范围是围绕着零和遵循传统的着色（绿色为负，积极折变红色）。 MXY图m2v不包括彩条。包括有颜色，mxy.plot可以使用。


值----------Value----------

A vector V of length  ((Ngc*Nsc)*(Ngr*Nsr)) is produced. The values of V represents the spatial
一个向量V长度((Ngc*Nsc)*(Ngr*Nsr))产生。 V值代表的空间


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias E. Futschik (<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)



参见----------See Also----------

v2m, mxy.plot
v2m，mxy.plot


举例----------Examples----------



# LOADING DATA NOT-NORMALISED[加载数据没有，正规化]
data(sw)
# CONVERSION FROM VECTOR TO MATRIX[从向量矩阵转换]
M <- v2m(maM(sw)[,1],Ngc=maNgc(sw),Ngr=maNgr(sw),Nsc=maNsc(sw),Nsr=maNsr(sw),visu=TRUE)

# BACK-CONVERSION FROM MATRIX TO VECTOR[后从矩阵到矢量的转换]
V <- m2v(M,Ngc=maNgc(sw),Ngr=maNgr(sw),Nsc=maNsc(sw),Nsr=maNsr(sw),visu=TRUE)

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