sequenceDesignMatrix(oligo)
sequenceDesignMatrix()所属R语言包:oligo
Create design matrix for sequences
创建序列设计矩阵
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Creates design matrix for sequences.
创建序列设计矩阵。
用法----------Usage----------
sequenceDesignMatrix(seqs)
参数----------Arguments----------
参数:seqs
character vector of 25-mers.
character25个碱基的向量。
Details
详情----------Details----------
This assumes all sequences are 25bp long.
这是假设所有序列长25个基点。
The design matrix is often used when the objecive is to adjust intensities by sequence.
当的objecive是经常被用来调整序列的强度设计矩阵。
值----------Value----------
Matrix with length(seqs) rows and 75 columns.
长度(seqs)行和75列的矩阵。
举例----------Examples----------
genSequence <- function(x)
paste(sample(c("A", "T", "C", "G"), 25, rep=TRUE), collapse="", sep="")
seqs <- sapply(1:10, genSequence)
X <- sequenceDesignMatrix(seqs)
Y <- rnorm(10, mean=12, sd=2)
Ydemean <- Y-mean(Y)
X[1:10, 1:3]
fit <- lm(Ydemean~X)
coef(fit)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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