readSummaries(oligo)
readSummaries()所属R语言包：oligo
Read summaries generated by crlmm
读取由crlmm生成摘要
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function read the different summaries generated by crlmm.
此功能读取crlmm产生的不同汇总。
用法----------Usage----------
readSummaries(type, tmpdir)
参数----------Arguments----------
参数：type
type of summary of character class: 'alleleA', 'alleleB', 'alleleA-sense', 'alleleA-antisense', 'alleleB-sense', 'alleleB-antisense', 'calls', 'llr', 'conf'.
character类摘要类型：“alleleA，alleleB”，alleleA感“，”alleleA反义，alleleB常识，alleleB反义，呼吁，LLR“ ，conf的。
参数：tmpdir
directory containing the output saved by crlmm
目录包含由crlmm保存输出
Details
详情----------Details----------
On the 50K and 250K arrays, given a SNP, there are probes on both strands (sense and antisense). For this reason, the options 'alleleA-sense', 'alleleA-antisense', 'alleleB-sense' and 'alleleB-antisense' should be used **only** with such arrays (XBA, HIND, NSP or STY).
在50K和250K的阵列，给定一个SNP，有两个股（正义和反义）探针。出于这个原因，应该使用选项“alleleA感”，“alleleA反义，alleleB常识”和alleleB反义** **等阵列（XBA后，NSP或STY）。
On the SNP 5.0 and SNP 6.0 platforms, this distinction does not exist in terms of algorithm (note that the actual strand could be queried from the annotation package). For these arrays, options 'alleleA', 'alleleB' are the ones to be used.
SNP 5.0和SNP 6.0平台上的，这种区别不存在算法（注，实际链可以从质疑的注释包）。对于这些阵列，选项“alleleA，alleleB是要使用的。
The options calls, llr and conf will return, respectivelly, the CRLMM calls, log-likelihood ratios (for devel purpose **only**) and CRLMM confidence calls matrices.
选项calls，llr和conf将返回，respectivelly，CRLMM检测，对数似然比（**只为开发目的**）和CRLMM信心呼叫矩阵。
值----------Value----------
Matrix with values of summaries.
矩阵的摘要值。
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-2-26 08:17:20
