flags(oligoClasses)
flags()所属R语言包:oligoClasses
Batch-level summary of SNP flags.
一批高度概括的SNP标志。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Used to flag SNPs with low minor allele frequencies, or for possible problems during the CN estimation step. Currently, this is primarily more for internal use.
用来标志单核苷酸多态性与低次要等位基因频率,或可能出现的问题在CN估计一步。目前,这主要是供内部使用。
用法----------Usage----------
flags(object)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of class CNSet
一个对象的类CNSet
值----------Value----------
A matrix or ff_matrix object with rows corresponding to markers and columns corresponding to batch.
一个matrix或ff_matrix行对应到相应的批次的标志和列对象。
参见----------See Also----------
batchStatistics
batchStatistics
举例----------Examples----------
x <- matrix(runif(250*96*2, 0, 2), 250, 96*2)
test1 <- new("CNSet", alleleA=x, alleleB=x, call=x, callProbability=x,
batch=as.character(rep(letters[1:2], each=96)))
dim(flags(test1))
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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