plot.FDR.result(OCplus)
plot.FDR.result()所属R语言包:OCplus
Plot the empirical FDR as a function of the cutoff level
截止水平的功能,如绘制的经验FDR
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Plots the output from EOC. The resulting graph is the empirical counterpart to those produced by TOC, i.e. the estimated FDR as a function of the cutoff-level on the t-statistic.
图EOC的输出。生成的图形是产生的经验对口TOC,即估计为t-统计的截止级功能FDR。
用法----------Usage----------
plot.FDR.result(x, add=FALSE, sensitivity.show = TRUE, legend.show = FALSE,
xlim, ylim = c(0, 1), xlab, ylab, main, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object created by EOC
EOC创建的对象
参数:add
logical value indicating whether to add to an existing plot or start a new one
逻辑值,该值指示是否添加到现有的图,或启动一个新的
参数:sensitivity.show
logical value indicating whether to show the classical sensitivity for testing one hypothesis as a function of the cutoff level.
逻辑值,该值指示是否显示截止水平的功能测试一个假设的古典灵敏度。
参数:legend.show
logical value indicating whether to add a legend to the plot
逻辑值,该值指示是否添加一个传奇的图
参数:xlim, ylim
limits for the horizontal and vertical axis
限制在水平和垂直轴
参数:xlab, ylab
axis labels
轴标签
参数:main
plot title
图标题
参数:...
the usual graphical parameters, passed to plot
通常的图形参数,传递plot的
作者(S)----------Author(s)----------
A. Ploner
参见----------See Also----------
EOC
EOC
举例----------Examples----------
# We simulate a small example with 5 percent regulated genes and[我们模拟一个小例子,用5%的调节基因和]
# a rather large effect size[一个相当大的规模效应]
set.seed(2003)
xdat = matrix(rnorm(50000), nrow=1000)
xdat[1:25, 1:25] = xdat[1:25, 1:25] - 2
xdat[26:50, 1:25] = xdat[26:50, 1:25] + 2
grp = rep(c("Sample A","Sample B"), c(25,25))
# Compute the EOC without plotting[没有绘图,计算平机会]
ret = EOC(xdat, grp, plot=FALSE)
# Some possible arrangements[一些可能的安排]
par(mfrow=c(2,2))
plot(ret)
plot(ret, legend=TRUE)
plot(ret, sensitivity=FALSE)
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