readNuPoP(NuPoP)
readNuPoP()所属R语言包:NuPoP
R function for plotting the predicted nucleosome positioning map and nucleosome occupancy map
R函数绘制预测的核小体定位图和核小体占用图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function reads in the prediction results generated by predNuPoP for specified region.
此功能读取predNuPoP指定区域产生的预测结果。
用法----------Usage----------
readNuPoP(file,startPos,endPos)
参数----------Arguments----------
参数:file
the prediction output file name from predNuPoP function.
预测产量从predNuPoP函数的文件名
参数:startPos
the start position in the DNA sequence for prediction results plotting.
在DNA序列的预测结果绘制的起始位置。
参数:endPos
the end position in the DNA sequence for prediction results plotting.
在DNA序列的预测结果绘制的结束位置。
举例----------Examples----------
library(NuPoP)
predNuPoP(system.file("extdata", "test.seq", package="NuPoP"),species=7,model=4)
## the prediction results are stored in the current working directory[#的预测结果都存储在当前工作目录]
## the user should replace "system.file("extdata","test.seq_Prediction4.txt",package="NuPoP")"[#用户应取代“。系统(”extdata“,”test.seq_Prediction4.txt“,包=的”NuPoP“)”]
## by the actual path and file name generated from prediction.[#从预测产生的实际路径和文件名。]
temp=readNuPoP(system.file("extdata","test.seq_Prediction4.txt",package="NuPoP"),startPos=1,endPos=5000)
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