R语言 nudge包 norm1b()函数中文帮助文档(中英文对照)

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norm1b(nudge)
norm1b()所属R语言包：nudge

                                        Function for normalizing the mean and variance (or just the variance) of single replicate log ratios
                                         功能标准化单复制log比率的均值和方差（或方差）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This performs a robust loess normalization of the variance of the log ratios in a single replicate experiment by regressing the absolute (mean normalized) log ratios on the log intensities and using the fitted values to scale the (mean normalized) log ratio for each gene.
执行倒退log强度绝对（平均归一）log的比例和使用的拟合值（归）log比规模为每个基因的变异在一个单一的复制实验log比率强劲黄土标准化。


用法----------Usage----------


norm1b(logratio, logintensity, span1 = 0.6, span2 = 0.2, mean.norm=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：logratio
A vector or single-column matrix of log (base 2) ratios of gene expressions in two samples, if mean.norm is FALSE the log ratios should be already mean normalized.
矩阵向量或单柱的log（基数为2）两个样本中的基因表达比例，如果mean.norm是FALSElog比率应已意味着归。


参数：logintensity
A vector or single-column matrix of log (base 2) total intensities (defined as the product) of gene expressions in the two samples.
矩阵向量或单柱的log总强度（基2）两个样本中的基因表达（定义为产品）。


参数：span1
Proportion of data used to fit the loess regression of the log ratios on the log intensities for the mean normalization.
log比率平均标准化log强度，以适应局部加权回归的数据比例。


参数：span2
Proportion of data used to fit the loess regression of the absolute (mean normalized) log ratios on the log intensities for the variance normalization.
比例用于适应局部加权回归的绝对（平均归log比）方差标准化的log强度的数据。


参数：mean.norm
A logical value indicating whether or not a mean normalization should be performed prior to the variance normalization.
一个逻辑值，指明是否平均标准化之前，应执行的变异标准化。


值----------Value----------

A vector or single-column matrix of mean and variance normalized log (base 2) ratios of gene expressions in two samples.
向量或单柱矩阵的均值和方差归log（基数为2）两个样本中的基因表达比例。


作者（S）----------Author(s)----------


N. Dean and A. E. Raftery



参考文献----------References----------




参见----------See Also----------

norm1a,norm1c,norm1d,norm2c,norm2d
norm1a，norm1c，norm1d，norm2c，norm2d


举例----------Examples----------


data(like)
lR<-log(like[,1],2)-log(like[,2],2)
lI<-log(like[,1],2)+log(like[,2],2)

lRnorm<-norm1b(lR,lI,mean.norm=TRUE)


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