export.wig(nucleR)
export.wig()所属R语言包:nucleR
Export values in WIG format
出口假发格式的值
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Export coverage/intensity values in WIG format, compatible with UCSC genome browser, IGB, and others
出口覆盖/强度值在假发格式,IGB UCSC基因组浏览器,兼容,以及其他
用法----------Usage----------
export.wig(data, name, chrom="", filepath=name)
参数----------Arguments----------
参数:data
Coverage/intensity values (numeric
覆盖/强度值(数字
参数:name
Name of the track
赛道名称
参数:chrom
Information about chromosome if not inferrable from data (only for numeric vectors)
有关染色体,如果没有推理的data(只适用于数字向量)
参数:filepath
Filepath where to save the object. Chromosome name and "wig" extension will be automatically added
文件路径在哪里保存对象。染色体的名字和“假发”的延伸,将自动加入
值----------Value----------
(none)
(无)
作者(S)----------Author(s)----------
Oscar Flores <a href="mailtoflores@mmb.pcb.ub.es">oflores@mmb.pcb.ub.es</a>
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
#Load data[加载数据]
data(nucleosome_htseq)
cover = coverage.rpm(nucleosome_htseq)
#Create wig file[创建假发文件]
export.wig(cover, name="example_track")
#This would create the file "example_track.chr1.wig" with:[这将创建文件“example_track.chr1.wig”:]
#track type=wiggle_0 name="example_track"[跟踪型= wiggle_0名称=的“example_track”]
#fixedStep chrom=chr1 start=1 step=1[CHROM fixedStep = chr1开始= 1步= 1]
#55.55247[55.55247]
#55.55247[55.55247]
#55.55247[55.55247]
#277.7623[277.7623]
#388.8673[388.8673]
#...[...]
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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