R语言 nucleR包 coverage.rpm()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

coverage.rpm(nucleR)
coverage.rpm()所属R语言包：nucleR

                                         Coverage calculation and normalization to reads per million (rpm)
                                         覆盖率计算和规范化，以每百万读取（转）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates the coverage values from a RangedData object (or anything with a defined coverage function associated) and returns the coverage normalized to reads per million, allowing the comparison of experiments with a different absolut number of reads.
计算从RangedData对象（或任何定义coverage功能相关）的覆盖率值，并返回读取每百万标准化的覆盖面，允许与读取不同的绝对数量比较实验。


用法----------Usage----------


coverage.rpm(data)



参数----------Arguments----------

参数：data
RangedData (or compatible) with the reads information  
RangedData（或兼容）与读取信息


值----------Value----------

RleList object with the coverage objects
RleList对象的覆盖对象


作者（S）----------Author(s)----------



Oscar Flores <a href="mailtoflores@mmb.pcb.ub.es">oflores@mmb.pcb.ub.es</a>




参见----------See Also----------

processReads, coverage
processReads，coverage


举例----------Examples----------


       
        #Load the example dataset and get the coverage[加载示例数据集，并获得覆盖]
        data(nucleosome_htseq)
        cov = coverage.rpm(nucleosome_htseq)

        print(cov)

        #Plot it[图]
        plot(as.vector(cov[["chr1"]]), type="l", ylab="coverage", xlab="position")

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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