R语言 NormqPCR包 stabMeasureRho()函数中文帮助文档(中英文对照)

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stabMeasureRho(NormqPCR)
stabMeasureRho()所属R语言包：NormqPCR

                                         Gene expression stability value rho
                                         基因表达的稳定值RHO

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computation of the gene expression stability value rho for real-time  quantitativ RT-PCR data. For more details we refer to  Andersen et al. (2004).
基因表达稳定价值RHO实时quantitativ RT-PCR检测数据的计算。有关详细信息，我们参考Andersen等。 （2004年）。


用法----------Usage----------


  stabMeasureRho(x,...)

  ## S4 method for signature 'x'
stabMeasureRho(x, group, log = TRUE, na.rm = TRUE, returnAll = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：x
matrix containing real-time quantitative  RT-PCR data, or qPCRBatch object  
矩阵包含实时定量RT-PCR数据，或qPCRBatch对象


参数：...
Extra arguments, detailed below  
额外的参数，下面详细介绍


参数：group
grouping factor, either a factor vector or a phenoData column called "Group"   
分组因素，要么因素向量或phenoData列的被称为“本集团”


参数：log
logical: is data on log-scale  
逻辑：大规模log数据


参数：na.rm
a logical value indicating whether NA values should be stripped before the computation proceeds.  
一个逻辑值，指示是否NA值前应计算收益剥离。


参数：returnAll
logical, return additional information.  
逻辑，返回更多的信息。


Details

详情----------Details----------

The gene expression stability value rho is computed. For more details see  Andersen et al. (2004).
基因表达的稳定值RHO计算。详细内容见Andersen等。 （2004年）。


值----------Value----------

numeric vector with gene expression stability values
数字向量与基因表达的稳定值

If returnAll == TRUE a list with the following components is returned
如果returnAll == TRUE以下组件列表返回


参数：rho
stability measure rho of Andersen et al. (2004)  
Andersen等措施稳定RHO。 （2004年）


参数：d
used by selectHKs  
用于selectHKs


参数：v
used by selectHKs  
用于selectHKs


作者（S）----------Author(s)----------


Matthias Kohl <a href="mailto:Matthias.Kohl@stamats.de">Matthias.Kohl@stamats.de</a>



参考文献----------References----------

Normalization of Real-Time Quantitative Reverse Transcription-PCR Data:  A Model-Based Variance Estimation Approach to Identify Genes Suited for Normalization, Applied to Bladder and Colon Cancer Data Sets.  CANCER RESEARCH 64, 5245-5250, August 1, 2004. http://cancerres.aacrjournals.org/cgi/content/full/64/15/5245

参见----------See Also----------

selectHKs
selectHKs


举例----------Examples----------


  data(Colon)
  group <- pData(Colon.qPCRBatch)[,"Group"]
  res.Colon <- stabMeasureRho(Colon.qPCRBatch, group = group,
                            log = FALSE)
  sort(res.Colon) # cf. Table 3 in Andersen et al (2004)[比照。表3安德森等人（2004年）]

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