trimMz-methods(MSnbase)
trimMz-methods()所属R语言包:MSnbase
Trims 'MSnExp' or 'Spectrum' instances
沿边MSnExp或谱的实例
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This method selects a range of MZ values in a single spectrum (Spectrum instances) or all the spectra of an experiment (MSnExp instances). The regions to trim are defined by the range of mzlim argument, such that MZ values < min(mzlim) and MZ values > max(mzlim) are trimmed away.
这种方法在一个单一的频谱(Spectrum实例)或光谱实验(MSnExp实例)的范围内选择一个锰锌值。修剪的区域定义范围由mzlim参数,例如锰锌值<min(mzlim)和MZ值>max(mzlim)削去。
方法----------Methods----------
Trims all spectra in MSnExp object according to mzlim. Returns a cleaned MSnExp instance.
修剪所有光谱MSnExp反对根据mzlim的。返回清洁MSnExp实例。
Trims the Spectrum object and retruns a new trimmed object.
修剪Spectrum对象和retruns一个新的修剪对象。
作者(S)----------Author(s)----------
Laurent Gatto <lg390@cam.ac.uk>
参见----------See Also----------
removePeaks and clean for other spectra processing methods.
removePeaks和clean其他谱加工方法。
举例----------Examples----------
mz <- 1:100
sp1 <- new("Spectrum2",
mz=mz,
intensity=abs(rnorm(length(mz))))
sp2 <- trimMz(sp1,c(25,75))
range(mz(sp1))
range(mz(sp2))
file <- dir(system.file(package="MSnbase",dir="extdata"),
full.name=TRUE,pattern="mzXML$")
aa <- readMSData(file,verbose=FALSE)
bb <- trimMz(aa,c(113,117))
range(mz(bb))
range(mz(bb))
processingData(bb)
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