R语言 mosaics包 MosaicsFit-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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MosaicsFit-class(mosaics)
MosaicsFit-class()所属R语言包：mosaics

                                        Class "MosaicsFit"
                                         类“MosaicsFit”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class represents MOSAiCS model fit.
这个类代表马赛克模型拟合。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("MosaicsFit", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("MosaicsFit", ...)。


插槽----------Slots----------




mosaicsEst: Object of class "MosaicsFitEst",
mosaicsEst：Object类的"MosaicsFitEst"，




mosaicsParam: Object of class "MosaicsFitParam",
mosaicsParam：Object类的"MosaicsFitParam"，




chrID: Object of class "character",
chrID：Object类的"character"，




coord: Object of class "numeric",
coord：Object类的"numeric"，




tagCount: Object of class "numeric",
tagCount：Object类的"numeric"，




bic1S: Object of class "numeric",
bic1S：Object类的"numeric"，




bic2S: Object of class "numeric",
bic2S：Object类的"numeric"，


方法----------Methods----------




estimates signature(object = "MosaicsFit"):
估计signature(object = "MosaicsFit")：




mosaicsPeak signature(object = "MosaicsFit"):
mosaicsPeaksignature(object = "MosaicsFit")：




plot signature(x = "MosaicsFit", y = "missing"):
图signature(x = "MosaicsFit", y = "missing")：




print signature(x = "MosaicsFit"):
打印signature(x = "MosaicsFit")：




show signature(object = "MosaicsFit"):
显示signature(object = "MosaicsFit")：


作者（S）----------Author(s)----------


Dongjun Chung, Pei Fen Kuan, Sunduz Keles



参考文献----------References----------

for the Analysis of ChIP-Seq Data", To appear in Journal of the American Statistical Association (http://pubs.amstat.org/doi/abs/10.1198/jasa.2011.ap09706).

参见----------See Also----------

mosaicsFit, mosaicsPeak, estimates.
mosaicsFit，mosaicsPeak，estimates。


举例----------Examples----------


showClass("MosaicsFit")
## Not run: [＃无法运行：]
library(mosaicsExample)
data(exampleFit)

exampleFit
plot(exampleFit)
estimates(exampleFit)

examplePeak <- mosaicsPeak( exampleFit, signalModel = "2S", FDR = 0.05 )

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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