R语言 MmPalateMiRNA包 fixOutliers()函数中文帮助文档(中英文对照)

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fixOutliers(MmPalateMiRNA)
fixOutliers()所属R语言包：MmPalateMiRNA

                                         'Fix' an RGList object with outlying values.  
                                         修复与离岛值RGList对象。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Imputes outlying values in one of the red foreground, red background, green foreground, or green background matrices of an RGList object created from Miltenyi Biotech miRXplore Microarrays. Uses the replicate structure of the array to impute the outlying values. Implicit assumption is that only one of the four replicated values for a probe is an outlying value.  
责难的红色前景，红色背景，绿色的前景，或绿色背景矩阵RGList从美天旎生物技术miRXplore微阵列创建的对象之一外围值。使用复制的阵列结构，意指外围值。隐含的假设是，只有一个复制的四个探针的值是一个边远的价值。


用法----------Usage----------


fixOutliers(mat, idx, gene.ids)



参数----------Arguments----------

参数：mat
One of the red foreground (R), red background (Rb), green foreground (G), or green background (Gb) matrices in an RGList object, which contains outlying values.
一个红色的前景（R），红色背景（Rb），绿色前景（G），或绿色背景（Gb）在RGList矩阵对象，其中包含离岛值。


参数：idx
Index of outlying values, as returned by the checkOutliers function.  See examples for usage.
离岛值指数，由checkOutliers函数返回。使用范例。


参数：gene.ids
Vector of gene IDs for each probe. See examples for usage.
每个探针基因标识的向量。使用范例。


Details

详情----------Details----------

The function is specific to RGList objects which were created from  Miltenyi Biotech miRXplore Microarrays, since it depends on the replicated structure of that array (probes spotted in quadruplicate) to impute the outlying probe values.  
函数其中从美天旎生物技术微阵列miRXplore创建RGList对象是具体的，因为它取决于该阵列（探针发现一式四份），意指外围探针值复制结构。


值----------Value----------

Returns a matrix with the outlying probe values imputed.
返回与一个矩阵外围探针归咎于值的。


参见----------See Also----------

checkOutliers, checkMVs, fixMVs
checkOutliers，checkMVs，fixMVs


举例----------Examples----------


data(PalateData)
outliers <- checkOutliers(PalateData)
PalateData$R <- fixOutliers(PalateData$R, outliers$Rout, PalateData$genes$Gene)

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