R语言 minfi包 read.450k()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.450k(minfi)
read.450k()所属R语言包：minfi

                                         Parsing IDAT files from Illumina methylation arrays.
                                         解析Illumina的甲基化阵列IDAT文件。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Parsing IDAT files from Illumina methylation arrays.
解析Illumina的甲基化阵列IDAT文件。


用法----------Usage----------


read.450k(basenames, extended = FALSE, verbose = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：basenames
The basenames or filenames of the IDAT files.  By basenames we mean the filename without the ending _Grn.idat or _Red.idat (such that each sample occur once).  By filenames we mean filenames including _Grn.idat or _Red.idat (but only one of the colors)
主档名或文件名，的IDAT文件。我们的主档名的意思是没有结局_Grn.idat或_Red.idat（如发生一次，每个样品）的文件名。通过文件名，我们的意思是文件名，包括_Grn.idat或_Red.idat（但只有一种颜色）


参数：extended
Should a RGChannelSet or a RGChannelSetExtended be returned.  
RGChannelSet或RGChannelSetExtended被退回。


参数：verbose
Should the function be verbose?
如果函数是冗长的吗？


值----------Value----------

An object of class RGChannelSet or RGChannelSetExtended.
一个对象类RGChannelSet或RGChannelSetExtended。


作者（S）----------Author(s)----------



Kasper Daniel Hansen<a href="mailto:khansen@jhsph.edu">khansen@jhsph.edu</a>.




参见----------See Also----------

read.450k.exp for a convenience function for reading an experiment, read.450k.sheet for reading a sample sheet and RGChannelSet for the output class.
read.450k.exp为方便阅读实验，read.450k.sheet读取一个示例表和功能RGChannelSet输出类。


举例----------Examples----------


if(require(minfiData)) {

baseDir <- system.file("extdata", package = "minfiData")
RGSet <- read.450k(file.path(baseDir, "5723646052",
    c("5723646052_R02C02", "5723646052_R04C01")))

}

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