MethylSet-class(minfi)
MethylSet-class()所属R语言包:minfi
Class MethylSet
类MethylSet
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This class holds preprocessed data for Illumina methylation microarrays.
这个类拥有Illumina的甲基化芯片的预处理数据。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created by calls of the form new("MethylSet", Meth, Unmeth, ...).
创建对象可以通过检测的形式new("MethylSet", Meth, Unmeth, ...)。
插槽----------Slots----------
preprocessMethod: Object of class "character". This contains the preprocess method used to create the data. This is a a character vector of length 3, the first component is the preprocessing method, followed by the version of minfi used to do the preprocessing followed by the version of the manifest package
preprocessMethod类"character"的对象。这包含用于创建数据的预处理方法。这是AA特征向量的长度为3,第一部分是,随后由minfi用来做预处理列表包的版本版本的预处理方法
assayData: Object of class "AssayData". This
assayData类"AssayData"的对象。这
phenoData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
phenoData类"AnnotatedDataFrame"的对象。
featureData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
featureData类"AnnotatedDataFrame"的对象。
experimentData: Object of class "MIAxE".
experimentData类"MIAxE"的对象。
annotation: Object of class "character".
annotation类"character"的对象。
protocolData: Object of class "AnnotatedDataFrame".
protocolData类"AnnotatedDataFrame"的对象。
.__classVersion__: Object of class "Versions".
.__classVersion__类"Versions"的对象。
延伸----------Extends----------
Class "eSet", directly. Class "VersionedBiobase", by class "eSet", distance 2. Class "Versioned", by class "eSet", distance 3.
类"eSet",直接。类"VersionedBiobase"类"eSet",距离2。类"Versioned"类"eSet",距离3。
方法----------Methods----------
show: The show method
showshow方法
initialize: The initialize method, see above
initialize:initialize方法,见上面
作者(S)----------Author(s)----------
Kasper Daniel Hansen <a href="mailto:khansen@jhsph.edu">khansen@jhsph.edu</a>.
参见----------See Also----------
eSet for the basic class structure. Objects of this class are for example created from an RGChannelSet using preprocessRaw.
eSet基本类结构。例如用RGChannelSetpreprocessRaw创建这个类的对象。
举例----------Examples----------
showClass("MethylSet")
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