acore(Mfuzz)
acore()所属R语言包:Mfuzz
Extraction of alpha cores for soft clusters
提取的α核心软聚类
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function extracts genes forming the alpha cores of
此功能形成的α芯中提取的基因
用法----------Usage----------
acore(eset,cl,min.acore=0.5)
参数----------Arguments----------
参数:eset
object of the class ExpressionSet.
对象类ExpressionSet。
参数:cl
An object of class flcust as produced by mfuzz.
的flcust类的对象生产mfuzz。
参数:min.acore
minimum membership values of gene belonging to the cluster core.
最小的成员值的基因属于聚类的核心。
值----------Value----------
The function produces an list of alpha cores including genes and
函数产生的α核心的,包括基因和列表
作者(S)----------Author(s)----------
Matthias E. Futschik
(<a href="http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik">http://itb.biologie.hu-berlin.de/~futschik</a>)
举例----------Examples----------
if (interactive()){
### Data loaing and pre-processing[#数据loaing和前处理]
data(yeast) # data set includes 17 measurements[数据集包括17个测量]
yeastF <- filter.NA(yeast)
yeastF <- fill.NA(yeastF)
yeastF <- standardise(yeastF)
### Soft clustering and visualisation[#软聚类和可视化]
cl <- mfuzz(yeastF,c=20,m=1.25)
acore.list <- acore(yeastF,cl=cl,min.acore=0.7)
}
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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