R语言 methylumi包 getAssayDataNameSubstitutions()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getAssayDataNameSubstitutions(methylumi)
getAssayDataNameSubstitutions()所属R语言包：methylumi

                                         Return a data.frame of AssayData name substitutions.
                                         返回一个数据框AssayData名称替换。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The Illumina methylation platforms use two distinct platforms, the "goldengate" platform and the "infinium" platform.  Each of these uses different file formats as well as different assay techologies.  To make the downstream data handling more straightforward and uniform between the two different systems, a simple mapping from the column names in the output files from the Illumina software is used to convert things from Red/Green or Cy5/Cy3 to unmethylated/methylated.  This function simply returns that mapping.
Illumina的甲基化平台使用两个不同的平台，“金门”平台和“infinium”平台。这些都使用不同的文件格式，以及不同的检测技术的探究。使下行数据处理更加直观和统一之间的两个不同的系统，从简单的映射在从Illumina的软件输出文件中的列名是用来转换来自红/绿或Cy5/Cy3事情甲基化/甲基。这个函数只是简单地返回的映射。


用法----------Usage----------


getAssayDataNameSubstitutions()



Details

详情----------Details----------

A file in the extdata directory called "substitutions.txt" contains two columns.  The function loads this file and uses the first column as a match against column names in the data file (with the "sample part" removed).  If matched, the second column gives the replacement.  
在称为“substitutions.txt”extdata目录的文件包含两列。该函数加载这个文件，并作为对数据文件中（“范例的一部分”去掉）的列名的比赛中使用的第一列。如果匹配，第二列给出了更换。


值----------Value----------

A data.frame with two columns, regex and replacement.
与两列，正则表达式和替换的数据框。


作者（S）----------Author(s)----------



Sean Davis <seandavi@gmail.com>




举例----------Examples----------


getAssayDataNameSubstitutions()

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。