R语言 methylumi包 estimateM()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

estimateM(methylumi)
estimateM()所属R语言包：methylumi

                                         Estimate methylation M-value matrix
                                         估计甲基化的M值矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Estimate methylation M-value matrix from MethyLumiM-class object or eSet-class object, which include methylated and unmethylated probe intensities
估计甲基化的M值矩阵从MethyLumiM类对象或ESET类对象，其中包括甲基化和甲基化的探针强度


用法----------Usage----------


estimateM(methyLumiM, returnType=c("ExpressionSet", "matrix"), offset=1)



参数----------Arguments----------

参数：methyLumiM
MethyLumiM-class object or eSet-class object, which include methylated and unmethylated probe intensities  
MethyLumiM类对象或的ESET一流的对象，其中包括甲基化和甲基化的探针强度


参数：returnType
determine whether return an ExpressionSet (MethyLumiM in this case) or matrix object
确定是否返回一个ExpressionSet（在这种情况下，MethyLumiM）或矩阵对象


参数：offset
offset added to the  methylated and unmethylated probe intensities when estimating the M-value  
偏移添加到甲基化和甲基化的探针强度估计的M值时，


Details

详情----------Details----------

M-value is the log2 ratio between Illumina methylated and unmethylated probe intensities. As variations of small intensities can cause big changes in the ratio estimation, so an offset is added to methylated and unmethylated probe intensities when estimating the M-value.
M  - 值之间Illumina的甲基化和甲基化的探针强度的log2比例。由于小强度的变化可能导致的比例估计的大变化，所以一个偏移估计的M值时，添加甲基化和甲基化的探针强度。

Please check the lumi package for more details of estimateM function.
请LUMI包为estimateM功能的更多细节。


值----------Value----------

A MethyLumiM or matrix object of methylation M-value
一个甲基化的M值MethyLumiM或矩阵对象


作者（S）----------Author(s)----------



Pan DU




参考文献----------References----------


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注：
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